Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S7

Galnt10, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Galnt10Q6P9S7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Galnt10Q6P9S7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Galnt10Q6P9S7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Galnt10Q6P9S7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Galnt10Q6P9S7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Galnt10Q6P9S7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Galnt10Q6P9S7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Galnt10Q6P9S7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Galnt10Q6P9S7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Galnt10Q6P9S7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Galnt10Q6P9S7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Galnt10Q6P9S7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Galnt10Q6P9S7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Galnt10Q6P9S7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Galnt10Q6P9S7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Galnt10Q6P9S7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Galnt10Q6P9S7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Galnt10Q6P9S7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Galnt10Q6P9S7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Galnt10Q6P9S7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Galnt10Q6P9S7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Galnt10Q6P9S7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Galnt10Q6P9S7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Galnt10Q6P9S7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Galnt10Q6P9S7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Galnt10Q6P9S7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Galnt10Q6P9S7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Galnt10Q6P9S7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Galnt10Q6P9S7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Galnt10Q6P9S7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Galnt10Q6P9S7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Galnt10Q6P9S7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Galnt10Q6P9S7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Galnt10Q6P9S7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Galnt10Q6P9S7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Galnt10Q6P9S7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Galnt10Q6P9S7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Galnt10Q6P9S7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Galnt10Q6P9S7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Galnt10Q6P9S7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Galnt10Q6P9S7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Galnt10Q6P9S7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Galnt10Q6P9S7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Galnt10Q6P9S7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Galnt10Q6P9S7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Galnt10Q6P9S7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Galnt10Q6P9S7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Galnt10Q6P9S7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Galnt10Q6P9S7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Galnt10Q6P9S7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Galnt10Q6P9S7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Galnt10Q6P9S7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Galnt10Q6P9S7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Galnt10Q6P9S7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Galnt10Q6P9S7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Galnt10Q6P9S7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Galnt10Q6P9S7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Galnt10Q6P9S7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Galnt10Q6P9S7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Galnt10Q6P9S7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Galnt10Q6P9S7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Galnt10Q6P9S7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Galnt10Q6P9S7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Galnt10Q6P9S7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Galnt10Q6P9S7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Galnt10Q6P9S7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Galnt10Q6P9S7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Galnt10Q6P9S7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Galnt10Q6P9S7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Galnt10Q6P9S7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Galnt10Q6P9S7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Galnt10Q6P9S7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Galnt10Q6P9S7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Galnt10Q6P9S7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Galnt10Q6P9S7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Galnt10Q6P9S7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Galnt10Q6P9S7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Galnt10Q6P9S7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Galnt10Q6P9S7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Galnt10Q6P9S7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Galnt10Q6P9S7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Galnt10Q6P9S7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Galnt10Q6P9S7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Galnt10Q6P9S7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Galnt10Q6P9S7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Galnt10Q6P9S7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Galnt10Q6P9S7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Galnt10Q6P9S7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Galnt10Q6P9S7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Galnt10Q6P9S7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Galnt10Q6P9S7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Galnt10Q6P9S7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Galnt10Q6P9S7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Galnt10Q6P9S7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Galnt10Q6P9S7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Galnt10Q6P9S7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Galnt10Q6P9S7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Galnt10Q6P9S7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Galnt10Q6P9S7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Galnt10Q6P9S7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms