Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Apoa4P06728 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Apoa4P06728 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Apoa4P06728 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Apoa4P06728 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Apoa4P06728 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Apoa4P06728 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Apoa4P06728 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Apoa4P06728 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Apoa4P06728 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Apoa4P06728 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Apoa4P06728 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Apoa4P06728 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Apoa4P06728 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Apoa4P06728 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Apoa4P06728 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Apoa4P06728 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Apoa4P06728 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Apoa4P06728 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Apoa4P06728 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Apoa4P06728 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Apoa4P06728 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Apoa4P06728 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Apoa4P06728 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Apoa4P06728 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Apoa4P06728 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Apoa4P06728 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Apoa4P06728 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Apoa4P06728 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Apoa4P06728 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Apoa4P06728 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Apoa4P06728 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Apoa4P06728 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Apoa4P06728 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Apoa4P06728 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Apoa4P06728 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Apoa4P06728 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Apoa4P06728 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Apoa4P06728 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Apoa4P06728 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Apoa4P06728 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Apoa4P06728 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Apoa4P06728 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Apoa4P06728 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Apoa4P06728 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Apoa4P06728 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Apoa4P06728 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Apoa4P06728 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Apoa4P06728 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Apoa4P06728 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Apoa4P06728 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Apoa4P06728 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Apoa4P06728 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Apoa4P06728 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Apoa4P06728 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Apoa4P06728 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Apoa4P06728 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Apoa4P06728 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Apoa4P06728 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Apoa4P06728 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Apoa4P06728 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Apoa4P06728 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apoa4P06728 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apoa4P06728 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apoa4P06728 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apoa4P06728 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apoa4P06728 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apoa4P06728 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apoa4P06728 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apoa4P06728 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Apoa4P06728 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apoa4P06728 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apoa4P06728 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apoa4P06728 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apoa4P06728 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Apoa4P06728 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Apoa4P06728 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Apoa4P06728 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Apoa4P06728 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apoa4P06728 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Apoa4P06728 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apoa4P06728 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apoa4P06728 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Apoa4P06728 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Apoa4P06728 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Apoa4P06728 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Apoa4P06728 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apoa4P06728 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apoa4P06728 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apoa4P06728 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apoa4P06728 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Apoa4P06728 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apoa4P06728 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apoa4P06728 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Apoa4P06728 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apoa4P06728 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apoa4P06728 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apoa4P06728 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apoa4P06728 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apoa4P06728 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms