Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Upk1aQ9D132 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Upk1aQ9D132 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Upk1aQ9D132 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Upk1aQ9D132 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Upk1aQ9D132 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Upk1aQ9D132 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Upk1aQ9D132 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Upk1aQ9D132 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Upk1aQ9D132 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Upk1aQ9D132 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Upk1aQ9D132 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Upk1aQ9D132 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Upk1aQ9D132 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Upk1aQ9D132 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Upk1aQ9D132 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Upk1aQ9D132 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Upk1aQ9D132 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Upk1aQ9D132 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Upk1aQ9D132 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Upk1aQ9D132 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Upk1aQ9D132 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Upk1aQ9D132 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Upk1aQ9D132 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Upk1aQ9D132 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Upk1aQ9D132 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Upk1aQ9D132 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Upk1aQ9D132 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Upk1aQ9D132 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Upk1aQ9D132 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Upk1aQ9D132 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Upk1aQ9D132 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Upk1aQ9D132 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Upk1aQ9D132 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Upk1aQ9D132 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Upk1aQ9D132 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Upk1aQ9D132 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Upk1aQ9D132 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Upk1aQ9D132 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Upk1aQ9D132 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Upk1aQ9D132 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Upk1aQ9D132 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Upk1aQ9D132 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Upk1aQ9D132 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Upk1aQ9D132 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Upk1aQ9D132 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Upk1aQ9D132 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Upk1aQ9D132 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Upk1aQ9D132 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Upk1aQ9D132 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Upk1aQ9D132 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Upk1aQ9D132 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Upk1aQ9D132 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Upk1aQ9D132 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Upk1aQ9D132 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Upk1aQ9D132 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Upk1aQ9D132 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Upk1aQ9D132 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Upk1aQ9D132 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Upk1aQ9D132 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Upk1aQ9D132 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Upk1aQ9D132 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Upk1aQ9D132 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Upk1aQ9D132 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Upk1aQ9D132 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Upk1aQ9D132 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Upk1aQ9D132 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Upk1aQ9D132 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Upk1aQ9D132 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Upk1aQ9D132 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Upk1aQ9D132 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Upk1aQ9D132 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Upk1aQ9D132 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Upk1aQ9D132 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Upk1aQ9D132 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Upk1aQ9D132 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Upk1aQ9D132 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Upk1aQ9D132 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Upk1aQ9D132 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Upk1aQ9D132 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Upk1aQ9D132 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Upk1aQ9D132 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Upk1aQ9D132 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Upk1aQ9D132 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Upk1aQ9D132 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Upk1aQ9D132 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Upk1aQ9D132 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Upk1aQ9D132 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Upk1aQ9D132 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Upk1aQ9D132 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Upk1aQ9D132 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Upk1aQ9D132 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Upk1aQ9D132 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Upk1aQ9D132 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Upk1aQ9D132 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Upk1aQ9D132 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Upk1aQ9D132 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Upk1aQ9D132 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Upk1aQ9D132 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Upk1aQ9D132 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms