RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN11	YML043C	YGL140C	P53120	1219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	MRS2	Q01926	470 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	YMR102C	Q03177	834 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	LAM1	P38851	1228 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	SIT1	P39980	628 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	ACF4	P47129	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	UBP15	P50101	1230 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	JJJ1	P53863	590 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	SML1	Q04964	104 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	NUT2	Q06213	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	ESC2	Q06340	456 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	SYT1	Q06836	1226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	PEX19	Q07418	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	REV3	P14284	1504 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	SWI6	P09959	803 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	DIT1	P21623	536 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	SLA1	P32790	1244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	OCA5	P38738	679 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	QDR1	P40475	563 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	YFL034W	P43564	1073 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	MSN5	P52918	1224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	TRS33	Q99394	268 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	TSC11	P40061	1430 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	ESP1	Q03018	1630 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	BRF1	P29056	596 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	SEC8	P32855	1065 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	MGE1	P38523	228 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	ATG36	P46983	293 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	DNM1	P54861	757 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	SSK2	P53599	1579 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	NUF2	P33895	451 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	RTT107	P38850	1070 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	SSN3	P39073	555 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	MPH1	P40562	993 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
RRN11	YML043C	WTM2	Q12206	467 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	STB3	Q12427	513 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	LSO1	Q3E827	93 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	STU1	P38198	1513 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	RAD50	P12753	1312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	BEM4	P39011	633 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	NNF1	P47149	201 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	PKH1	Q03407	766 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	LCD1	Q04377	747 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	FRT1	Q99332	602 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	MHP1	P43638	1398 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	RPO31	P04051	1460 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	NUP145	P49687	1317 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	MCM2	P29469	868 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	TAF1	P46677	1066 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	YJR107W	P47145	328 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	HUL5	P53119	910 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	SCC2	Q04002	1493 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	MSH1	P25846	959 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	MET4	P32389	672 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	SKN7	P38889	622 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	ARO80	Q04052	950 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	YPR172W	Q06608	200 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	SFI1	Q12369	946 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	UBP1	P25037	809 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	SUV3	P32580	737 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	ELM1	P32801	640 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	NTH2	P35172	780 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	EXO84	P38261	753 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	VPS41	P38959	992 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	CEP3	P40969	608 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN11	YML043C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 42.3 ms