RNA–Protein interactions for RNA: YML039W

YML039W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YML039W, Length 5,268 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML039WYML039W GSY1P23337 708 aa2.93□□□□□ -1.94
YML039WYML039W VPS21P36017 210 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
YML039WYML039W YJL070CP40361 888 aa2.93□□□□□ -1.94
YML039WYML039W SLM3Q12093 417 aa2.93□□□□□ -1.94
YML039WYML039W TY3B-GQ99315 1547 aa2.93□□□□□ -1.94
YML039WYML039W SUP45P12385 437 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W CLB2P24869 491 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W MIC60P36112 540 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W PEA2P40091 420 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W BUD6P41697 788 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W ADR1P07248 1323 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W PYC1P11154 1178 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W FUB1P25659 250 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W MAC1P35192 417 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W BRL1P38770 471 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W TAF1P46677 1066 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W PCL10P53124 433 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W YNL134CP53912 376 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W PPM2Q08282 695 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W MCD1Q12158 566 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W CIT1P00890 479 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W RPP0P05317 312 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W MRP7P12687 371 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W SEC23P15303 768 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W PRP4P20053 465 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W GUT1P32190 709 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W BOI1P38041 980 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W BZZ1P38822 633 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W CAJ1P39101 391 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W NAS2P40555 220 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W GSM1P42950 618 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W OSW7P43611 510 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W YGL242CP53066 181 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W ICL2Q12031 575 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W RSF2P46974 1380 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W RNA1P11745 407 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W MCM1P11746 286 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W GAL11P19659 1081 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W MSH1P25846 959 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W HOG1P32485 435 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W YEL043WP32618 956 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W NGR1P32831 672 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W YKL100CP34248 587 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W GYP8P43570 497 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W YPP1P46951 817 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W HXT17P53631 564 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W TBF1Q02457 562 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W HRQ1Q05549 1077 aa2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
YML039WYML039W GCD6P32501 712 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W RDH54P38086 958 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W YKE2P52553 114 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W CIK1Q01649 594 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W YVC1Q12324 675 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W RKR1Q04781 1562 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W TRP5P00931 707 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W SPC72P39723 622 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W RPN7Q06103 429 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W ATG11Q12527 1178 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W NUP145P49687 1317 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W CDC37P06101 506 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W SSB1P11484 613 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W MRPL25P23369 157 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W PKC1P24583 1151 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W SCJ1P25303 377 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W YMR124WP39523 943 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W SSB2P40150 613 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W CST6P40535 587 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W STU2P46675 888 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W MNN11P46985 422 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W TRS130Q03660 1102 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W CMS1Q07897 291 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W KRE5P22023 1365 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W DAL7P21826 554 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W PLP2Q12017 286 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W GNT1Q12096 491 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W PHM7Q12252 991 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W MRPL7P36519 292 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W UBP15P50101 1230 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W TLG2Q08144 397 aa2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W CMR1Q12510 522 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
YML039WYML039W ATG2P53855 1592 aa2.9□□□□□ -1.94
YML039WYML039W TUF1P02992 437 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.94
YML039WYML039W RED1P14291 827 aa2.9□□□□□ -1.94
YML039WYML039W CWH43P25618 953 aa2.9□□□□□ -1.94
YML039WYML039W MCM4P30665 933 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.94
YML039WYML039W RGT1P32862 1170 aa2.9□□□□□ -1.94
YML039WYML039W REI1P38344 393 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.94
YML039WYML039W YJL049WP47048 450 aa2.9□□□□□ -1.94
YML039WYML039W ERO1Q03103 563 aa2.9□□□□□ -1.94
YML039WYML039W HPR1P17629 752 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W GIC1P38785 314 aa2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W YJR061WP40355 935 aa2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W JJJ3P47138 172 aa2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W VPS25P47142 202 aa2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 101 ms