RNA–Protein interactions for RNA: YKR067W

GPT2, Transcript of Glycerol-3-phosphate/dihydroxyacetone phosphate sn-1 acyltransferase, yeast

Gene GPT2, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GPT2	YKR067W	RPN4	Q03465	531 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	ERG12	P07277	443 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	ROX1	P25042	368 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	MRM1	P25270	412 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	TTI1	P36097	1038 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	APE4	P38821	490 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	BBC1	P47068	1157 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	YJL007C	P47080	104 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	SCY1	P53009	804 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	YOR378W	Q08902	515 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	RRI2	Q12348	645 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	SWI1	P09547	1314 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	DEP1	P31385	405 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	NUP133	P36161	1157 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	UGA2	P38067	497 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	IES5	P40060	125 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	RAD17	P48581	401 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	GCR2	Q01722	534 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	LYS2	P07702	1392 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	HOM3	P10869	527 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	HOL1	P53389	586 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	RMD1	Q03441	430 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	GGA1	Q06336	557 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	BCH2	P36122	765 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	KEL2	P50090	882 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	YGR016W	P53209	190 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	ATG16	Q03818	150 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	STB3	Q12427	513 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	CDC16	P09798	840 aa		6.52	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	YEN1	P40028	759 aa		6.52	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	PEX8	P53248	589 aa		6.52	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	VPS64	Q03944	604 aa		6.52	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	YML083C	Q04526	418 aa		6.52	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	KAR5	Q04746	504 aa		6.52	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		6.52	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	PET123	P17558	318 aa		6.52	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	COQ8	P27697	501 aa		6.52	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	SLA1	P32790	1244 aa		6.52	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	NIP100	P33420	868 aa		6.52	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	MNN1	P39106	762 aa		6.52	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	AAD3	P25612	363 aa		6.51	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.51	□□□□□ -1.37	not detected
GPT2	YKR067W	YKL133C	P36066	463 aa		6.51	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	VAC8	P39968	578 aa		6.51	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	ACF4	P47129	309 aa		6.51	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	PEX21	P50091	288 aa		6.51	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	FOL1	P53848	824 aa		6.51	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	CTR9	P89105	1077 aa		6.51	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	YPL191C	Q08930	360 aa		6.51	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	RTP1	Q12751	981 aa		6.51	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	APN1	P22936	367 aa		6.5	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	MSP1	P28737	362 aa		6.5	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	YAP1801	P38856	637 aa		6.5	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	ALD3	P54114	506 aa		6.5	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	SRS2	P12954	1174 aa		6.5	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	POL4	P25615	582 aa		6.5	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	RAD27	P26793	382 aa		6.5	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	MXR1	P40029	184 aa		6.5	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	DAK2	P43550	591 aa		6.5	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	NPA3	P47122	385 aa		6.5	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	RSC1	P53236	928 aa		6.5	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	MEC3	Q02574	474 aa		6.5	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	COX6	P00427	148 aa		6.49	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	ATG19	P35193	415 aa		6.49	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	FCP1	Q03254	732 aa		6.49	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	RNH1	Q04740	348 aa		6.49	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	PCL8	Q08966	492 aa		6.49	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	RIM15	P43565	1770 aa		6.49	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
GPT2	YKR067W	VPS41	P38959	992 aa		6.49	□□□□□ -1.37

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