RNA–Protein interactions for RNA: YGR214W

RPS0A, Transcript of Ribosomal 40S subunit protein S0A, yeast

Gene RPS0A, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0A	YGR214W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS0A	YGR214W	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0A	YGR214W	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS0A	YGR214W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS0A	YGR214W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS0A	YGR214W	TY1A-BR	Q12217	440 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0A	YGR214W	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0A	YGR214W	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0A	YGR214W	ADR1	P07248	1323 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS0A	YGR214W	TAO3	P40468	2376 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RPS0A	YGR214W	FBP1	P09201	348 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	ATG1	P53104	897 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	TUB4	P53378	473 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	IRC4	Q03036	179 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	SRT1	Q03175	343 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	THI22	Q06490	572 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	RTT109	Q07794	436 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	SIS2	P36024	562 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	MAL31	P38156	614 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	PSF2	P40359	213 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	MTC3	P53077	123 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	TBF1	Q02457	562 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	YML020W	Q03722	664 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	GSC2	P40989	1895 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	FLO11	P08640	1367 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	PUP1	P25043	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	TPD3	P31383	635 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	PEP12	P32854	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	VAB2	P40003	282 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	SLX8	P40072	274 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	YFH7	P43591	353 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	YPP1	P46951	817 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	NET1	P47035	1189 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	RPA14	P50106	137 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	EAR1	Q03212	550 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	MCM16	Q12262	181 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	YDL206W	Q12424	762 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
RPS0A	YGR214W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	SPT23	P35210	1082 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	OCT1	P35999	772 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	MCD4	P36051	919 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	ERG7	P38604	731 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	UBP12	P39538	1254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	APL6	P46682	809 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	TOS4	Q06266	489 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	YDL144C	Q07589	356 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	YPR015C	Q12531	247 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	RAD53	P22216	821 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	TGL4	P36165	910 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	LDH1	P38139	375 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	LYS14	P40971	790 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	ULP1	Q02724	621 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	YML083C	Q04526	418 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	PIF1	P07271	859 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	ADP1	P25371	1049 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	MDL2	P33311	773 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	YFL040W	P43562	540 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	VPS62	P53285	467 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	PPM2	Q08282	695 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	RRI2	Q12348	645 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	DAL5	P15365	543 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	ISF1	P32488	338 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	FIG4	P42837	879 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	CLA4	P48562	842 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS0A	YGR214W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS0A	YGR214W	SWC3	P31376	625 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS0A	YGR214W	YBL028C	P38202	106 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS0A	YGR214W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS0A	YGR214W	ACA1	P39970	489 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS0A	YGR214W	PIP2	P52960	996 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS0A	YGR214W	YAF9	P53930	226 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS0A	YGR214W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS0A	YGR214W	FRA1	Q07825	749 aa		4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.4 ms