RNA–Protein interactions for RNA: RDN25-2

RDN25-2, Transcript of 25S ribosomal RNA (25S rRNA), yeastyeast

Gene RDN25-2, Length 3,396 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN25-2RDN25-2 PSY4P38193 441 aa10.65□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 UBP16Q02863 499 aa10.65□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 CDC37P06101 506 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 SFB2P53953 876 aa10.64□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 ARR1Q06596 294 aa10.64□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 ATG13Q06628 738 aa10.64□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 RUD3Q12234 484 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 VPS5Q92331 675 aa10.64□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 RMT2Q03305 412 aa10.64□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 RBA50Q04418 439 aa10.64□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 CIR2Q08822 631 aa10.64□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 IOC2Q12072 812 aa10.64□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 PET111P08468 800 aa10.63□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 MPH1P40562 993 aa10.63□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 NKP1Q12493 238 aa10.63□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 PEP3P27801 918 aa10.63□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 SAC6P32599 642 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 CTK3P46963 296 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 PSK2Q08217 1101 aa10.63□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 PDC1P06169 563 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 PTH2P34222 208 aa10.62□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 YHL017WP38745 532 aa10.62□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 TFG1P41895 735 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 YPT11P48559 417 aa10.62□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 SEC5P89102 971 aa10.62□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 YOL098CQ12496 1037 aa10.62□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 DCD1P06773 312 aa10.62□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 COG4Q06096 861 aa10.62□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 CMS1Q07897 291 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 GYP5Q12344 894 aa10.62□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 KEX2P13134 814 aa10.62□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 AFT2Q08957 416 aa10.62□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 GLE1Q12315 538 aa10.62□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 RRP1P35178 278 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 PIM1P36775 1133 aa10.61□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 YMR196WQ04336 1088 aa10.61□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 TSR2Q06672 205 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 HXK1P04806 485 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 MATALPHA2P0CY08 210 aa10.61□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 HMLALPHA2P0CY09 210 aa10.61□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 YPR097WQ06839 1073 aa10.61□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 CDC3P32457 520 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 MVP1P40959 511 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 STR2P47164 639 aa10.6□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 KRE28Q04431 385 aa10.6□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 RRP9Q06506 573 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 PSR1Q07800 427 aa10.6□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa10.6□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 GGA1Q06336 557 aa10.6□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 BRF1P29056 596 aa10.6□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 REI1P38344 393 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 OMS1Q06668 471 aa10.6□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 ARG8P18544 423 aa10.59□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 RRI2Q12348 645 aa10.59□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 SMC6Q12749 1114 aa10.59□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 SPT8P38915 602 aa10.59□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 APT1P49435 187 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 SFH1Q06168 426 aa10.59□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 ECM32P32644 1121 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 YJR008WP47085 338 aa10.59□□□□□ -0.71
RDN25-2RDN25-2 YKL133CP36066 463 aa10.58□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 MRPS28P21771 286 aa10.58□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 SEC65P29478 273 aa10.58□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 SER1P33330 395 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 YLR407WQ06070 228 aa10.58□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 LAM4P38800 1345 aa10.57□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 RPT3P33298 428 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data10.57□□□□□ -0.72not detected
RDN25-2RDN25-2 ISW1P38144 1129 aa10.57□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 EXO84P38261 753 aa10.57□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 IMH1Q06704 911 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 VPS1P21576 704 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 DAL7P21826 554 aa10.57□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 MCM16Q12262 181 aa10.57□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 HDA1P53973 706 aa10.56□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 KRS1P15180 591 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 SPT16P32558 1035 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 STO1P34160 861 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 YKT6P36015 200 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 SET1P38827 1080 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 VPS75P53853 264 aa10.56□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 AKR1P39010 764 aa10.55□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 CAJ1P39101 391 aa10.55□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 UTP4Q06679 776 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data10.55□□□□□ -0.72not detected
RDN25-2RDN25-2 DIT2P21595 489 aa10.55□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 RPN10P38886 268 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 TFG2P41896 400 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 UBC1P21734 215 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 ASF1P32447 279 aa10.54□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 YLR271WQ06152 274 aa10.54□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 SSP2Q08646 371 aa10.54□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 WHI5Q12416 295 aa10.54□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 CDC6P09119 513 aa10.54□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 KAR9P32526 644 aa10.54□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 BUD2P33314 1104 aa10.54□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 HCR1Q05775 265 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
RDN25-2RDN25-2 YCG1Q06680 1035 aa10.54□□□□□ -0.72
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