RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa37.78■■■■□ 3.64
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm21671G3UY31 267 aa37.74■■■■□ 3.63
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa37.74■■■■□ 3.63
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Stk31Q99MW1 1018 aa37.72■■■■□ 3.63
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Parp14Q2EMV9 1817 aa37.71■■■■□ 3.63
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dusp27Q148W8 1138 aa37.68■■■■□ 3.62
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 TnikP83510 1323 aa37.66■■■■□ 3.62
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kank1E9Q238 1360 aa37.59■■■■□ 3.61
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zfp142G5E869 1843 aa37.59■■■■□ 3.61
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cabp2Q9JLK4 216 aa37.55■■■■□ 3.6
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slx1bQ8BX32 270 aa37.54■■■■□ 3.6
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Qtrt2B8ZXI1 415 aa37.52■■■■□ 3.6
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 OptnQ8K3K8 584 aa37.52■■■■□ 3.6
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 CrklP47941 303 aa37.51■■■■□ 3.6
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.6
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Simc1E9Q6E9 1354 aa37.5■■■■□ 3.59
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trpm3Q5F4S9 1721 aa37.49■■■■□ 3.59
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atxn3Q9CVD2 355 aa37.49■■■■□ 3.59
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Txnrd1Q9JMH6 613 aa37.49■■■■□ 3.59
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 L3mbtl2P59178 703 aa37.48■■■■□ 3.59
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Plin1Q8CGN5 517 aa37.48■■■■□ 3.59
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Acsbg1Q99PU5 721 aa37.48■■■■□ 3.59
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slit1Q80TR4 1531 aa37.48■■■■□ 3.59
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Znf526Q8BI66 675 aa37.47■■■■□ 3.59
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP37.47■■■■□ 3.59
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Col15a1O35206 1367 aa37.47■■■■□ 3.59
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Plekhd1B2RPU2 505 aa37.44■■■■□ 3.58
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa37.44■■■■□ 3.58
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Amotl1Q9D4H4 968 aa37.44■■■■□ 3.58
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa37.41■■■■□ 3.58
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa37.4■■■■□ 3.58
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa37.4■■■■□ 3.58
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pard3Q99NH2 1333 aa37.4■■■■□ 3.58
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rtl5Q5DTT4 599 aa37.38■■■■□ 3.58
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Smim5Q8BT42 78 aa37.38■■■■□ 3.58
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 RgmbQ7TQ33 436 aa37.38■■■■□ 3.57
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ankrd50F7BE84 1390 aa37.37■■■■□ 3.57
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 FocadA2AKG8 1798 aa37.37■■■■□ 3.57
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gnai1B2RSH2 354 aa37.37■■■■□ 3.57
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gnai3Q9DC51 354 aa37.37■■■■□ 3.57
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arfgef2A2A5R2 1792 aa37.37■■■■□ 3.57
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Erbb3Q61526 1339 aa37.36■■■■□ 3.57
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm10471E9Q1C7 252 aa37.36■■■■□ 3.57
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ksr2Q3UVC0 959 aa37.34■■■■□ 3.57
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ecm2Q5FW85 670 aa37.31■■■■□ 3.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zeb2Q9R0G7 1215 aa37.31■■■■□ 3.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Aplp2Q06335 707 aa37.3■■■■□ 3.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zranb3Q6NZP1 1069 aa37.3■■■■□ 3.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sos1Q62245 1319 aa37.28■■■■□ 3.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 ThemisQ8BGW0 636 aa37.26■■■■□ 3.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa37.26■■■■□ 3.56
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa37.21■■■■□ 3.55
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa37.2■■■■□ 3.55
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa37.14■■■■□ 3.54
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Usp16Q99LG0 825 aa37.12■■■■□ 3.53
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