RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eif4a2P10630 407 aa30.07■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rad17Q6NXW6 688 aa30.07■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Abca15E9PWH4 1668 aa30.07■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Robo1O89026 1612 aa30.07■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PtprvP70289 1705 aa30.07■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cadps2Q8BYR5 1297 aa30.07■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 TatQ8QZR1 454 aa30.07■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hoxc9P09633 260 aa30.06■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zmym3Q9JLM4 1370 aa30.05■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Neurod2Q62414 383 aa30.05■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dnajc10Q9DC23 793 aa30.05■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PalmQ9Z0P4 383 aa30.05■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmem132eQ6IEE6 982 aa30.04■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Znf541Q0GGX2 1363 aa30.04■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tom1O88746 492 aa30.04■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fmnl2A2APV2 1086 aa30.02■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bcl9lQ67FY2 1494 aa30.01■■■□□ 2.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Liat1Q810M6 228 aa30.01■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 TnrQ8BYI9 1358 aa30.01■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ciz1Q8VEH2 845 aa29.99■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nid2O88322 1403 aa29.99■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Myt1Q8CFC2 1127 aa29.99■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccne1Q61457 408 aa29.98■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm21698A0A087WQP8 267 aa29.97■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm21671G3UY31 267 aa29.97■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Apaf1O88879 1249 aa29.97■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fchsd2Q3USJ8 740 aa29.95■■■□□ 2.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 MpripP97434 1024 aa29.94■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ptpn23Q6PB44 1692 aa29.94■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Parp14Q2EMV9 1817 aa29.94■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Acsbg1Q99PU5 721 aa29.93■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Qtrt2B8ZXI1 415 aa29.93■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc4a3P16283 1227 aa29.93■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Smim5Q8BT42 78 aa29.93■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Znf526Q8BI66 675 aa29.92■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Spef2Q8C9J3 1734 aa29.92■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eya1P97767 591 aa29.92■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zfp142G5E869 1843 aa29.91■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Card10P58660 1021 aa29.91■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rtl5Q5DTT4 599 aa29.9■■■□□ 2.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q4VA45 678 aa29.89■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Txnrd1Q9JMH6 613 aa29.89■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mcm10Q0VBD2 885 aa29.88■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ecm2Q5FW85 670 aa29.88■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Amotl2Q8K371 772 aa29.88■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 ZgpatQ8VDM1 511 aa29.88■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa29.88■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa29.87■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa29.87■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa29.87■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa29.87■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zfp777B9EKF4 885 aa29.86■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 AampJ3QN89 436 aa29.85■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atxn3Q9CVD2 355 aa29.84■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 HdgfP51859 237 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gas2l2Q5SSG4 860 aa29.83■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Plin1Q8CGN5 517 aa29.83■■■□□ 2.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cavin4A2AMM0 362 aa29.82■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dusp27Q148W8 1138 aa29.81■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kdm6aO70546 1401 aa29.78■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trim58Q5NCC9 485 aa29.78■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa29.78■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Stk31Q99MW1 1018 aa29.78■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slit2Q9R1B9 1521 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 OptnQ8K3K8 584 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Apbb1Q9QXJ1 710 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Znf521Q6KAS7 1311 aa29.76■■■□□ 2.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CrklP47941 303 aa29.76■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cabp2Q9JLK4 216 aa29.75■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Col15a1O35206 1367 aa29.74■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ksr2Q3UVC0 959 aa29.74■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pak3Q61036 559 aa29.73■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 RgmbQ7TQ33 436 aa29.72■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slx1bQ8BX32 270 aa29.72■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Iqcf3Q9D498 203 aa29.72■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 TkfcQ8VC30 578 aa29.72■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Egfem1Q8C088 590 aa29.7■■■□□ 2.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa29.7■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Swt1Q9DBQ9 907 aa29.69■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa29.68■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slit1Q80TR4 1531 aa29.68■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pard3Q99NH2 1333 aa29.68■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 HypkQ9CR41 129 aa29.66■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ankrd50F7BE84 1390 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Simc1E9Q6E9 1354 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10471E9Q1C7 252 aa29.64■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 FocadA2AKG8 1798 aa29.64■■■□□ 2.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pank1Q8K4K6 548 aa29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 56.1 ms