RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa48,68■■■■■ 5,38
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Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Abcc8B2RUS7 1588 aa46,66■■■■■ 5,06
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 ScribQ80U72 1612 aa44,38■■■■■ 4,69
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dcaf1Q80TR8 1506 aa43,22■■■■■ 4,51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kdm5dQ62240 1548 aa43,16■■■■■ 4,5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 NacadQ5SWP3 1504 aa43,09■■■■■ 4,49
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rhox8Q6VSS7 320 aa43,03■■■■■ 4,48
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa42,4■■■■■ 4,38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sycp2Q9CUU3 1500 aa42,21■■■■■ 4,35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc180J3QNE4 1664 aa41,91■■■■■ 4,3
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Baz1aO88379 1555 aa41,88■■■■■ 4,29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rtl1Q7M732 1744 aa41,64■■■■■ 4,26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Crybg2B7ZCC2 1516 aa41,54■■■■■ 4,24
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 BicraF8VPZ9 1578 aa41,48■■■■■ 4,23
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP41,12■■■■■ 4,17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Smarca2Q6DIC0 1577 aa40,78■■■■■ 4,12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa40,28■■■■■ 4,04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa40,15■■■■■ 4,02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP40,05■■■■■ 4
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Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP39,9■■■■□ 3,98
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP39,68■■■■□ 3,94
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Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Synj1Q8CHC4 1574 aa39,55■■■■□ 3,92
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CftrP26361 1476 aa39,52■■■■□ 3,92
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trim41Q5NCC3 630 aa39,5■■■■□ 3,91
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa39,38■■■■□ 3,9
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Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Wdr62Q3U3T8 1523 aa39,13■■■■□ 3,86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Frmpd1A2AKB4 1549 aa39,1■■■■□ 3,85
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Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa38,89■■■■□ 3,82
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa38,77■■■■□ 3,8
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 HrcG5E8J6 738 aa38,71■■■■□ 3,79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Golga3P55937 1487 aa38,69■■■■□ 3,78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam135aQ6NS59 1506 aa38,64■■■■□ 3,78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP38,62■■■■□ 3,77
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Unc13aQ4KUS2 1712 aa38,56■■■■□ 3,76
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cngb1E1AZ71 1325 aa38,54■■■■□ 3,76
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Top2bQ64511 1612 aa38,49■■■■□ 3,75
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ubl4bQ9CQ84 188 aa38,25■■■■□ 3,71
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP38,18■■■■□ 3,7
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Baz1bQ9Z277 1479 aa38,12■■■■□ 3,69
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lamc3Q9R0B6 1581 aa38,09■■■■□ 3,69
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kif15Q6P9L6 1387 aa38,06■■■■□ 3,68
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fmn1Q05860 1466 aa38,02■■■■□ 3,68
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 TnnQ80Z71 1560 aa37,98■■■■□ 3,67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa37,98■■■■□ 3,67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Chic1Q8CBW7 227 aa37,87■■■■□ 3,65
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cux2P70298 1426 aa37,8■■■■□ 3,64
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mrc2Q64449 1479 aa37,76■■■■□ 3,63
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cep164Q5DU05 1446 aa37,71■■■■□ 3,63
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Camsap1A2AHC3 1581 aa37,54■■■■□ 3,6
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP37,51■■■■□ 3,6
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc18Q640L5 1455 aa37,51■■■■□ 3,6
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Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Il27Q8K3I6 234 aa37,45■■■■□ 3,59
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kif21aQ9QXL2 1672 aa37,24■■■■□ 3,55
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP37,2■■■■□ 3,55
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa37,15■■■■□ 3,54
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Grin2bQ01097 1482 aa37,15■■■■□ 3,54
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gab3Q8BSM5 595 aa37,1■■■■□ 3,53
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP37,08■■■■□ 3,53
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP37,06■■■■□ 3,52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 NrkQ9R0G8 1455 aa36,99■■■■□ 3,51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PtprkP35822 1457 aa36,92■■■■□ 3,5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Duox2A2AQ99 1517 aa36,92■■■■□ 3,5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Crocc2F6XLV1 1638 aa36,87■■■■□ 3,49
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Shroom4Q1W617 1475 aa36,87■■■■□ 3,49
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa36,86■■■■□ 3,49
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa36,84■■■■□ 3,49
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Efcab5A0JP43 1406 aa36,84■■■■□ 3,49
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Plb1Q3TTY0 1478 aa36,76■■■■□ 3,47
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP36,75■■■■□ 3,47
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP36,74■■■■□ 3,47
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Npm2Q80W85 207 aa36,7■■■■□ 3,47
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Samd9lQ69Z37 1561 aa36,64■■■■□ 3,46
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cep162Q6ZQ06 1403 aa36,58■■■■□ 3,45
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP36,52■■■■□ 3,44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP36,51■■■■□ 3,43
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Arhgap35Q91YM2 1499 aa36,47■■■■□ 3,43
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ift140E9PY46 1464 aa36,45■■■■□ 3,42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa36,44■■■■□ 3,42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Disp1Q3TDN0 1521 aa36,41■■■■□ 3,42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rad54l2Q99NG0 1466 aa36,41■■■■□ 3,42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zeb1Q64318 1117 aa36,4■■■■□ 3,42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 SynmQ70IV5 1561 aa36,35■■■■□ 3,41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Map3k1P53349 1493 aa36,34■■■■□ 3,41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP36,32■■■■□ 3,4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Magi3Q9EQJ9 1476 aa36,26■■■■□ 3,39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Myt1lP97500 1187 aa36,26■■■■□ 3,39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Grin2aP35436 1464 aa36,2■■■■□ 3,39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP36,19■■■■□ 3,38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP36,17■■■■□ 3,38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pla2r1Q62028 1487 aa36,17■■■■□ 3,38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP36,16■■■■□ 3,38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Setd1bQ8CFT2 1985 aa36,13■■■■□ 3,37
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