RNA–Protein interactions for RNA: YOR372C

NDD1, Transcript of Transcriptional activator essential for nuclear division, yeast

Gene NDD1, Length 1,665 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NDD1	YOR372C	GIP2	P40036	548 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NDD1	YOR372C	RGD2	P43556	714 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NDD1	YOR372C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NDD1	YOR372C	NTA1	P40354	457 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NDD1	YOR372C	TED1	P40533	473 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NDD1	YOR372C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	RIP-Chip
NDD1	YOR372C	SFA1	P32771	386 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NDD1	YOR372C	KAE1	P36132	386 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NDD1	YOR372C	RAD55	P38953	406 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NDD1	YOR372C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
NDD1	YOR372C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NDD1	YOR372C	SMC1	P32908	1225 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NDD1	YOR372C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NDD1	YOR372C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NDD1	YOR372C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NDD1	YOR372C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NDD1	YOR372C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NDD1	YOR372C	FUS1	P11710	512 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	RNQ1	P25367	405 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	COQ2	P32378	372 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	TFA2	P36145	328 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	ALD3	P54114	506 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	SOG2	Q08817	791 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	PSY2	P40164	858 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	GUP1	P53154	560 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	KAR5	Q04746	504 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	RSC6	P25632	483 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	PAN5	P38787	379 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	UBP5	P39944	805 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	LEM3	P42838	414 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	YGR130C	P53278	816 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	DSE4	P53753	1117 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	SEA4	P38164	1038 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	QDR1	P40475	563 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	ATG1	P53104	897 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	YML020W	Q03722	664 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	YJR124C	P47159	448 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	UFD2	P54860	961 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	SPO71	Q03868	1245 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	GLO4	Q12320	285 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	HVG1	P0CE11	249 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	NEO1	P40527	1151 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	YNR065C	P53751	1116 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NDD1	YOR372C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	SAF1	P38352	637 aa		4.09	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	REC8	Q12188	680 aa		4.09	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	ACF4	P47129	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	CTR9	P89105	1077 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	RSC4	Q02206	625 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	ELG1	Q12050	791 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	AKR1	P39010	764 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	FET4	P40988	552 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	YCR015C	P25616	317 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	TRS120	Q04183	1289 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
NDD1	YOR372C	COB	P00163	385 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	CHS2	P14180	963 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	ERS1	P17261	260 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	NCE103	P53615	221 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	HAT1	Q12341	374 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	CYC7	P00045	113 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	SEG2	P34250	1132 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	LRG1	P35688	1017 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	ERP5	P38819	212 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	FAR11	P53917	953 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	YNL011C	P53980	444 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	MNL2	Q12205	849 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	RIM11	P38615	370 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	MDJ2	P42834	146 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	CDC55	Q00362	526 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	BSC2	Q05611	235 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	NPR1	P22211	790 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	DUR3	P33413	735 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	SLD2	P34252	453 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	MSH6	Q03834	1242 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
NDD1	YOR372C	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
NDD1	YOR372C	YHL008C	P38750	627 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NDD1	YOR372C	SPO74	P45819	413 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NDD1	YOR372C	TAF1	P46677	1066 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NDD1	YOR372C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NDD1	YOR372C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NDD1	YOR372C	FLP1	P03870	423 aa		4.01	□□□□□ -1.77
NDD1	YOR372C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77

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