RNA–Protein interactions for RNA: YML011C

RAD33, Transcript of Protein involved in nucleotide excision repair, yeast

Gene RAD33, Length 534 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD33	YML011C	OMA1	P36163	345 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RAD33	YML011C	RAD55	P38953	406 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RAD33	YML011C	BOL3	P39724	118 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RAD33	YML011C	NTA1	P40354	457 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RAD33	YML011C	DSE4	P53753	1117 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RAD33	YML011C	RLF2	Q12495	606 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RAD33	YML011C	FUS1	P11710	512 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	INP52	P50942	1183 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	GUP1	P53154	560 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	SOG2	Q08817	791 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	SMC1	P32908	1225 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	KAE1	P36132	386 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	PSY2	P40164	858 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	YLR122C	Q12312	125 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	TRP3	P00937	484 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	SAF1	P38352	637 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	AKR1	P39010	764 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	LEM3	P42838	414 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	REC8	Q12188	680 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	INO80	P53115	1489 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	YKR073C	P36153	106 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	YJR124C	P47159	448 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	YNR065C	P53751	1116 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	MED7	Q08278	222 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	CHS2	P14180	963 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	NEO1	P40527	1151 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	SPO71	Q03868	1245 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAD33	YML011C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.03	□□□□□ -1.6	not detected
RAD33	YML011C	YGR130C	P53278	816 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	ELG1	Q12050	791 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	GLO4	Q12320	285 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	HVG1	P0CE11	249 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	ERS1	P17261	260 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	NCE103	P53615	221 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	CTR9	P89105	1077 aa		5	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	KAR5	Q04746	504 aa		5	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	TOS1	P38288	455 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	QDR1	P40475	563 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	LIP5	P32875	414 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	FET4	P40988	552 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	CTH1	P47976	325 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	TAF7	Q05021	590 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	CYC7	P00045	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	COB	P00163	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
RAD33	YML011C	SPO74	P45819	413 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD33	YML011C	UFD2	P54860	961 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	RSC4	Q02206	625 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	ATG1	P53104	897 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	FAR11	P53917	953 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	GIC2	Q06648	383 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	AVT1	P47082	602 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	NPR1	P22211	790 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	DUR3	P33413	735 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	ACF4	P47129	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	RIM11	P38615	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	IRC24	P40580	263 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	YNL011C	P53980	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	TRS120	Q04183	1289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	MNL2	Q12205	849 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD33	YML011C	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAD33	YML011C	GPT2	P36148	743 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD33	YML011C	SEA4	P38164	1038 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD33	YML011C	SDH1	Q00711	640 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD33	YML011C	BSC2	Q05611	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD33	YML011C	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD33	YML011C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD33	YML011C	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD33	YML011C	YHL008C	P38750	627 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD33	YML011C	GCV1	P48015	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD33	YML011C	MSH6	Q03834	1242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD33	YML011C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD33	YML011C	YIG1	Q08956	461 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD33	YML011C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD33	YML011C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD33	YML011C	MMM1	P41800	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD33	YML011C	CDC55	Q00362	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD33	YML011C	YLL054C	Q12244	843 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD33	YML011C	FLP1	P03870	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD33	YML011C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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