RNA–Protein interactions for RNA: YKR079C

TRZ1, Transcript of tRNA 3'-end processing endonuclease tRNase Z, yeast

Gene TRZ1, Length 2,517 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRZ1	YKR079C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.84	□□□□□ -1.8	not detected
TRZ1	YKR079C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	YPL109C	Q02981	657 aa		3.84	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	TOS4	Q06266	489 aa		3.84	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	PMT7	Q06644	662 aa		3.83	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	MRPL16	P38064	232 aa		3.83	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	OPT2	Q06593	877 aa		3.83	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	SAP155	P43612	1002 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	PPT1	P53043	513 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	NUT1	P53114	1132 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	SCW11	P53189	542 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	CTR9	P89105	1077 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	HEH2	Q03281	663 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	COB	P00163	385 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	YJL049W	P47048	450 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	ALD3	P54114	506 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	ADI1	Q03677	179 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	OSH7	P38755	437 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	VAC8	P39968	578 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	MON1	P53129	644 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	YNR040W	P53736	256 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	ULP1	Q02724	621 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	FUS1	P11710	512 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	IDI1	P15496	288 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	CWC24	P53769	259 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	SQT1	P35184	431 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	YOL098C	Q12496	1037 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	RIM11	P38615	370 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	CDC34	P14682	295 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	DIT1	P21623	536 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	SHU2	P38957	223 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	RSM26	P47141	266 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	YAF9	P53930	226 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	TAF13	P11747	167 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	UGA4	P32837	571 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	DUR3	P33413	735 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	SRC1	Q03707	834 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	RTT10	Q08924	1013 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	PIC2	P40035	300 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	ROG3	P43602	733 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	GLO4	Q12320	285 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TRZ1	YKR079C	FPS1	P23900	669 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	GDE1	Q02979	1223 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	NPR1	P22211	790 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	MSC7	P38694	644 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	PEX28	P38848	579 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	CUZ1	P53899	274 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	RAD27	P26793	382 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	DUT1	P33317	147 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	PRK1	P40494	810 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	YJL181W	P46987	611 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	ENT3	P47160	408 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	MRL1	Q06815	381 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	SOG2	Q08817	791 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	FET4	P40988	552 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	XKS1	P42826	600 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	HVG1	P0CE11	249 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	LYS5	P50113	272 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	YDR444W	Q04093	687 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	GCR1	P07261	785 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	TFA2	P36145	328 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	CEM1	P39525	442 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	GNP1	P48813	663 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	NSE3	Q05541	303 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.74	□□□□□ -1.81	not detected
TRZ1	YKR079C	MET22	P32179	357 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	LEM3	P42838	414 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	OSW7	P43611	510 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	YGL140C	P53120	1219 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	YGR053C	P53234	283 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	PEX13	P80667	386 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TRZ1	YKR079C	CCP1	P00431	361 aa		3.74	□□□□□ -1.81

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