RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	ELG1	Q12050	791 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YJL135W	YJL135W	HAP4	P14064	554 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	YPT53	P36019	220 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	CIT3	P43635	486 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	PHO87	P25360	923 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	BSD2	P38356	321 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	YIL165C	P40446	119 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	MSH6	Q03834	1242 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	VMA3	P25515	160 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	PEP12	P32854	288 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	ISW1	P38144	1129 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	ORC3	P54790	616 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	ERS1	P17261	260 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	MRPL33	P20084	86 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	NFS1	P25374	497 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	CWH41	P53008	833 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	TFA2	P36145	328 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	LDH1	P38139	375 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	FAR11	P53917	953 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	RCM1	P53972	490 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	ALD3	P54114	506 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	CAB1	Q04430	367 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	FUS1	P11710	512 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	YBR287W	P38355	427 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	YOR223W	Q12015	292 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YJL135W	YJL135W	VAN1	P23642	535 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YJL135W	YJL135W	ADP1	P25371	1049 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YJL135W	YJL135W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YJL135W	YJL135W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YJL135W	YJL135W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YJL135W	YJL135W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YJL135W	YJL135W	RIM8	P53179	542 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YJL135W	YJL135W	NEO1	P40527	1151 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YJL135W	YJL135W	YJL007C	P47080	104 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YJL135W	YJL135W	ROM1	P53046	1155 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YJL135W	YJL135W	TRS33	Q99394	268 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YJL135W	YJL135W	GPT2	P36148	743 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YJL135W	YJL135W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YJL135W	YJL135W	MSN1	P22148	382 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YJL135W	YJL135W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YJL135W	YJL135W	KTR7	P40504	517 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YJL135W	YJL135W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YJL135W	YJL135W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YJL135W	YJL135W	PNS1	Q12412	539 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YJL135W	YJL135W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YJL135W	YJL135W	SOD2	P00447	233 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	SUV3	P32580	737 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	LEO1	P38439	464 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	AIM46	P38885	310 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	YJR124C	P47159	448 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	MRPL22	P53881	309 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	HVG1	P0CE11	249 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	GAL2	P13181	574 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	YBR197C	P38306	217 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	SSY1	Q03770	852 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	YMR074C	Q04773	145 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	TRE1	Q08919	783 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	YLL054C	Q12244	843 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	SIS2	P36024	562 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	FIR1	P40020	876 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	TOD6	P34219	525 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	FET4	P40988	552 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	BIM1	P40013	344 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	YML122C	Q03207	126 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	YDL177C	Q12257	170 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	GLO4	Q12320	285 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YJL135W	YJL135W	YLR358C	O13565	187 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YJL135W	YJL135W	CTS1	P29029	562 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YJL135W	YJL135W	PRO1	P32264	428 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YJL135W	YJL135W	PEX7	P39108	375 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YJL135W	YJL135W	ATG32	P40458	529 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YJL135W	YJL135W	ALT1	P52893	592 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YJL135W	YJL135W	YPL277C	Q08989	487 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YJL135W	YJL135W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YJL135W	YJL135W	ISC10	P32645	267 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YJL135W	YJL135W	GCV1	P48015	400 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YJL135W	YJL135W	YVC1	Q12324	675 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YJL135W	YJL135W	HXT8	P40886	569 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YJL135W	YJL135W	RGD2	P43556	714 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YJL135W	YJL135W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.42	□□□□□ -1.86	not detected
YJL135W	YJL135W	PTC7	P38797	343 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YJL135W	YJL135W	NTA1	P40354	457 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YJL135W	YJL135W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YJL135W	YJL135W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YJL135W	YJL135W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YJL135W	YJL135W	SNO2	P53823	222 aa		3.41	□□□□□ -1.86

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