RNA–Protein interactions for RNA: YGL239C

YGL239C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YGL239C, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGL239C	YGL239C	THI11	P47183	340 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	ALD3	P54114	506 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	RSC4	Q02206	625 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	YMR187C	Q03236	431 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	YML020W	Q03722	664 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	BSC2	Q05611	235 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	THI13	Q07748	340 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	GPI13	Q07830	1017 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	TFA2	P36145	328 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	YHL008C	P38750	627 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	PRY1	P47032	299 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	CTR9	P89105	1077 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	CDC55	Q00362	526 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	SLD2	P34252	453 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	RRM3	P38766	723 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	IPL1	P38991	367 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	COB	P00163	385 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	NEO1	P40527	1151 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	LSB6	P42951	607 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	YJR124C	P47159	448 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	SAM37	P50110	327 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	GAS5	Q08193	484 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	SOG2	Q08817	791 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	SLP1	Q12232	587 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	YDR215C	Q12240	137 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	GLO4	Q12320	285 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	FLP1	P03870	423 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	SEC20	P28791	383 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	TAT1	P38085	619 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	PPX1	P38698	397 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	PAN5	P38787	379 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	GUP1	P53154	560 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	BUD9	P53226	547 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	YNR065C	P53751	1116 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	WHI5	Q12416	295 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	SAC7	P17121	654 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	MET4	P32389	672 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	DUR3	P33413	735 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	SKN7	P38889	622 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	FET4	P40988	552 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	MON1	P53129	644 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	MCA1	Q08601	432 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	NPR1	P22211	790 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	LEM3	P42838	414 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	SPO71	Q03868	1245 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YGL239C	YGL239C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	HVG1	P0CE11	249 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	NUT1	P53114	1132 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	DSE4	P53753	1117 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	AI3	P03877	415 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	RIM11	P38615	370 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	MSH6	Q03834	1242 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	YCS4	Q06156	1176 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	PMT7	Q06644	662 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	OXR1	Q08952	273 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	ELG1	Q12050	791 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	ERS1	P17261	260 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	RSC6	P25632	483 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	SFA1	P32771	386 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	VPS35	P34110	944 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	DAK2	P43550	591 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	YAF9	P53930	226 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	YMR074C	Q04773	145 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	DAL4	Q04895	635 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	UGA4	P32837	571 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	SAP155	P43612	1002 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	POL32	P47110	350 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	YPL034W	Q03083	165 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	TOS4	Q06266	489 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	HEM3	P28789	327 aa		3.48	□□□□□ -1.85

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.7 ms