RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	MRPS18	P42847	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	ERF2	Q06551	359 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	MCD1	Q12158	566 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	KTR2	P33550	425 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	RRI2	Q12348	645 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	NTH2	P35172	780 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	SPO75	Q07798	868 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	ESP1	Q03018	1630 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	OPI1	P21957	404 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	STR2	P47164	639 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	RPA14	P50106	137 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	TGL2	P54857	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	CAB1	Q04430	367 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	REC8	Q12188	680 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	SRF1	Q12516	437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	HTA2	P04912	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	CYT1	P07143	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	STE5	P32917	917 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	YKL222C	P35995	705 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	PMT3	P47190	753 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	HLJ1	P48353	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	UBX4	P54730	416 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	ESC2	Q06340	456 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	HDA3	Q06623	655 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	YBR184W	P38299	523 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	PEA2	P40091	420 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	MEH1	Q02205	184 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	TFB2	Q02939	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	RPO31	P04051	1460 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	DAL5	P15365	543 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	YJR115W	P47152	169 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	RSC4	Q02206	625 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	UGO1	Q03327	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	RTP1	Q12751	981 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	YGL015C	P33199	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	IXR1	P33417	597 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	COG6	P53959	839 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	DAL4	Q04895	635 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	BSC2	Q05611	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	FOB1	O13329	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	YAP1801	P38856	637 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	AGE1	Q04412	482 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	NUP145	P49687	1317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	TAF13	P11747	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	KIP2	P28743	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	YBR071W	P38243	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	HSE1	P38753	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	GPG1	P53130	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	BAS1	P22035	811 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	NPR1	P22211	790 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	SSH4	P32343	579 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	SPC105	P53148	917 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	THI73	Q07904	523 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	FMP25	Q08023	583 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	ALR1	Q08269	859 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	PIP2	P52960	996 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	UME1	Q03010	460 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	MPD2	Q99316	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	NUD1	P32336	851 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	SMC1	P32908	1225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	TFC3	P34111	1160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	JNM1	P36224	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	PEX14	P53112	341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	INH1	P01097	85 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	SWI3	P32591	825 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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