RNA–Protein interactions for RNA: YBL053W

YBL053W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YBL053W, Length 375 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBL053W	YBL053W	PNS1	Q12412	539 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	ERS1	P17261	260 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	SPO71	Q03868	1245 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	GIP1	P38229	639 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	UBP1	P25037	809 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	PKC1	P24583	1151 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	ADP1	P25371	1049 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	DYS1	P38791	387 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	YIL165C	P40446	119 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	SOG2	Q08817	791 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	NEO1	P40527	1151 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	ORC3	P54790	616 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	VMA3	P25515	160 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	TOD6	P34219	525 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	TFA2	P36145	328 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	ISW1	P38144	1129 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	YBR287W	P38355	427 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	RIM8	P53179	542 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	GPT2	P36148	743 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	MRPL22	P53881	309 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	FAR11	P53917	953 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	SSY1	Q03770	852 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	YMR074C	Q04773	145 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	GAS4	Q08271	471 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YBL053W	YBL053W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	LDH1	P38139	375 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	KTR7	P40504	517 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	ALD3	P54114	506 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	YOR223W	Q12015	292 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	HAP4	P14064	554 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	MRPL33	P20084	86 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	PHO87	P25360	923 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	MRX10	Q05648	414 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	FUS1	P11710	512 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	CWH41	P53008	833 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	CAB1	Q04430	367 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	TRE1	Q08919	783 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	YLL054C	Q12244	843 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	SOD2	P00447	233 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	PRO1	P32264	428 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	YJR124C	P47159	448 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	CTS1	P29029	562 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	YJL007C	P47080	104 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	YPL277C	Q08989	487 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	YDL177C	Q12257	170 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	YLR358C	O13565	187 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	MSN1	P22148	382 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	VAN1	P23642	535 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	PEP12	P32854	288 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YBL053W	YBL053W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YBL053W	YBL053W	ROM1	P53046	1155 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YBL053W	YBL053W	PTC7	P38797	343 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YBL053W	YBL053W	AIM46	P38885	310 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YBL053W	YBL053W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
YBL053W	YBL053W	PEX7	P39108	375 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YBL053W	YBL053W	FIR1	P40020	876 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YBL053W	YBL053W	TRS33	Q99394	268 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YBL053W	YBL053W	SIS2	P36024	562 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YBL053W	YBL053W	FET4	P40988	552 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YBL053W	YBL053W	EAR1	Q03212	550 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YBL053W	YBL053W	YVC1	Q12324	675 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YBL053W	YBL053W	SUV3	P32580	737 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YBL053W	YBL053W	GTS1	P40956	396 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YBL053W	YBL053W	PUS9	Q12069	462 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YBL053W	YBL053W	HVG1	P0CE11	249 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YBL053W	YBL053W	YBR197C	P38306	217 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YBL053W	YBL053W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.03	□□□□□ -1.92	RIP-Chip
YBL053W	YBL053W	TRM2	P33753	639 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YBL053W	YBL053W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
YBL053W	YBL053W	SNM1	P40993	198 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YBL053W	YBL053W	ALT1	P52893	592 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YBL053W	YBL053W	SNO2	P53823	222 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YBL053W	YBL053W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YBL053W	YBL053W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.01	□□□□□ -1.93	not detected
YBL053W	YBL053W	MSE1	P48525	536 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YBL053W	YBL053W	GLO4	Q12320	285 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YBL053W	YBL053W	GAL2	P13181	574 aa		3	□□□□□ -1.93
YBL053W	YBL053W	ISC10	P32645	267 aa		3	□□□□□ -1.93
YBL053W	YBL053W	GCV1	P48015	400 aa		3	□□□□□ -1.93
YBL053W	YBL053W	SLI1	P53304	468 aa		3	□□□□□ -1.93
YBL053W	YBL053W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YBL053W	YBL053W	TAT2	P38967	592 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YBL053W	YBL053W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93

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