RNA–Protein interactions for RNA: YMR093W

UTP15, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene UTP15, Length 1,542 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP15	YMR093W	HXT8	P40886	569 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	MTO1	P53070	669 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	NUT2	Q06213	157 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	FIR1	P40020	876 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	RPB10	P22139	70 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	ASF1	P32447	279 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	IPL1	P38991	367 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	RGP1	P16664	663 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	RPC31	P17890	251 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	ALD2	P47771	506 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTP15	YMR093W	ISW1	P38144	1129 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	GIP1	P38229	639 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	THI12	P42883	340 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	THI5	P43534	340 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	THI11	P47183	340 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	SKP1	P52286	194 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	THI13	Q07748	340 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	FRT1	Q99332	602 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	MSN1	P22148	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	KTR2	P33550	425 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	RAD55	P38953	406 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	NTA1	P40354	457 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	MRPL16	P38064	232 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	YNL011C	P53980	444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	STB3	Q12427	513 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	APM2	P38700	605 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	ACO2	P39533	789 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	ROG3	P43602	733 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	DIT1	P21623	536 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	RGD2	P43556	714 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	CDC55	Q00362	526 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	RSC4	Q02206	625 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	MNL2	Q12205	849 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	WHI5	Q12416	295 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	BSD2	P38356	321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	PSY2	P40164	858 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	POL32	P47110	350 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	SAM37	P50110	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	HEH2	Q03281	663 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	MET4	P32389	672 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	MGE1	P38523	228 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	AIM46	P38885	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	CUZ1	P53899	274 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UTP15	YMR093W	FPS1	P23900	669 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	YIR007W	P40566	764 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	BSC2	Q05611	235 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
UTP15	YMR093W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
UTP15	YMR093W	VPS35	P34110	944 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	CEM1	P39525	442 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	YIL165C	P40446	119 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	ITC1	P53125	1264 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	YNR040W	P53736	256 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	CAF120	P53836	1060 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	RSC2	Q06488	889 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	CCP1	P00431	361 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	OXR1	Q08952	273 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	ATE1	P16639	503 aa		4.49	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	LYS5	P50113	272 aa		4.49	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.49	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	YHL008C	P38750	627 aa		4.48	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	MSC7	P38694	644 aa		4.47	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	DAK2	P43550	591 aa		4.47	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	YJR107W	P47145	328 aa		4.47	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	FLP1	P03870	423 aa		4.46	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	IDI1	P15496	288 aa		4.46	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	PPT1	P53043	513 aa		4.46	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.69
UTP15	YMR093W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.46	□□□□□ -1.69

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