RNA–Protein interactions for RNA: YML088W

UFO1, Transcript of F-box receptor protein, yeast

Gene UFO1, Length 2,007 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UFO1	YML088W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	MGM1	P32266	881 aa		10.89	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	BDF1	P35817	686 aa		10.89	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	CTH1	P47976	325 aa		10.89	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	SRC1	Q03707	834 aa		10.89	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	PMD1	P32634	1753 aa		10.88	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	SPO22	P40511	975 aa		10.88	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	CIR1	P42940	261 aa		10.88	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	HST1	P53685	503 aa		10.88	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	HPC2	Q01448	625 aa		10.88	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	IMP2'	P32351	346 aa		10.87	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	YIR042C	P40586	236 aa		10.87	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	BDF2	Q07442	638 aa		10.87	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	OPI1	P21957	404 aa		10.87	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	BBC1	P47068	1157 aa		10.87	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	DPH6	Q12429	685 aa		10.86	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	ICP55	P40051	511 aa		10.85	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	INM2	Q05533	292 aa		10.85	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	PIF1	P07271	859 aa		10.84	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	PEX19	Q07418	342 aa		10.84	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	TOS1	P38288	455 aa		10.84	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	APC11	Q12157	165 aa		10.84	□□□□□ -0.67
UFO1	YML088W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	KEX1	P09620	729 aa		10.83	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	PEP3	P27801	918 aa		10.83	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	PEX14	P53112	341 aa		10.83	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	KAR5	Q04746	504 aa		10.83	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	TAH18	Q12181	623 aa		10.83	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	DID4	P36108	232 aa		10.82	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	GRX7	P38068	203 aa		10.82	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	SPL2	P38839	148 aa		10.82	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	RSC1	P53236	928 aa		10.82	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	MBR1	P23493	339 aa		10.82	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	ALD3	P54114	506 aa		10.82	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	RPN12	P32496	274 aa		10.81	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	MET1	P36150	593 aa		10.81	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	IRC8	P47046	822 aa		10.81	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	SAS4	Q04003	481 aa		10.81	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	IRC3	Q06683	689 aa		10.81	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	FBP26	P32604	452 aa		10.8	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	YKE2	P52553	114 aa		10.8	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	PPM2	Q08282	695 aa		10.8	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.8	□□□□□ -0.68	not detected
UFO1	YML088W	TTI1	P36097	1038 aa		10.8	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	EPL1	P43572	832 aa		10.8	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	ALD2	P47771	506 aa		10.8	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	IRC4	Q03036	179 aa		10.8	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	RSM25	P40496	264 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	ELG1	Q12050	791 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	YBL086C	P38177	466 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	RKM3	P38222	552 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	COQ1	P18900	473 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	RDS1	P25611	832 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	ECM23	Q02710	187 aa		10.77	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	PSK2	Q08217	1101 aa		10.77	□□□□□ -0.68
UFO1	YML088W	FIG2	P25653	1609 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UFO1	YML088W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
UFO1	YML088W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
UFO1	YML088W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
UFO1	YML088W	YHL017W	P38745	532 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UFO1	YML088W	BUD6	P41697	788 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UFO1	YML088W	LCD1	Q04377	747 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UFO1	YML088W	YPL150W	Q12152	901 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UFO1	YML088W	AIM44	Q99299	758 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UFO1	YML088W	KRE2	P27809	442 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UFO1	YML088W	RER2	P35196	286 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UFO1	YML088W	RFC5	P38251	354 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UFO1	YML088W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
UFO1	YML088W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
UFO1	YML088W	SIS2	P36024	562 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UFO1	YML088W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	10.75	□□□□□ -0.69	not detected
UFO1	YML088W	TOS4	Q06266	489 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UFO1	YML088W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
UFO1	YML088W	MDL2	P33311	773 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UFO1	YML088W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69

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