RNA–Protein interactions for RNA: YLR057W

MNL2, Transcript of Putative mannosidase involved in ER-associated protein degradation, yeast

Gene MNL2, Length 2,550 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MNL2	YLR057W	VTC4	P47075	721 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MNL2	YLR057W	UFD2	P54860	961 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MNL2	YLR057W	CTR9	P89105	1077 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MNL2	YLR057W	CDC55	Q00362	526 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MNL2	YLR057W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MNL2	YLR057W	SPR28	Q04921	423 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MNL2	YLR057W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	IRE1	P32361	1115 aa		3.03	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	BSD2	P38356	321 aa		3.03	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	YJR098C	P47139	656 aa		3.03	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	MCM2	P29469	868 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	YNL011C	P53980	444 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	DUR3	P33413	735 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	NTA1	P40354	457 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	RGA2	Q06407	1009 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	ARG82	P07250	355 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	KAP122	P32767	1081 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	LDH1	P38139	375 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	SKP1	P52286	194 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	FAA3	P39002	694 aa		3	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	MET10	P39692	1035 aa		3	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	PSY2	P40164	858 aa		3	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	HST3	P53687	447 aa		3	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	DYS1	P38791	387 aa		3	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	RAD55	P38953	406 aa		3	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	NUP85	P46673	744 aa		3	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	ITC1	P53125	1264 aa		3	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	YOR296W	Q08748	1289 aa		3	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	UGA4	P32837	571 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	SMC1	P32908	1225 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	GIP1	P38229	639 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	MTO1	P53070	669 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	YNR040W	P53736	256 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	BSC2	Q05611	235 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	CYC8	P14922	966 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	MGE1	P38523	228 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	OCA5	P38738	679 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	TCB1	Q12466	1186 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	VPS35	P34110	944 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	YGR122W	P53272	402 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	FLP1	P03870	423 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	RGP1	P16664	663 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	ISW1	P38144	1129 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	SVF1	Q05515	481 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	YIL165C	P40446	119 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	OPT2	Q06593	877 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	MSC7	P38694	644 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	UBP15	P50101	1230 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	LSC2	P53312	427 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	VPS16	Q03308	798 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MNL2	YLR057W	RAD2	P07276	1031 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	TRK1	P12685	1235 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	SAM37	P50110	327 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	ALD3	P54114	506 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	DUT1	P33317	147 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	APM2	P38700	605 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	RGA1	P39083	1007 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	MSH6	Q03834	1242 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	SRF1	Q12516	437 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	MRP10	O75012	95 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	CCP1	P00431	361 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	IDI1	P15496	288 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	OSH7	P38755	437 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	PIC2	P40035	300 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	SAP155	P43612	1002 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	PIN2	Q12057	282 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	HVG1	P0CE11	249 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	MRPL16	P38064	232 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	AIM46	P38885	310 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	TAT2	P38967	592 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	FIR1	P40020	876 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	YTA6	P40328	754 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MNL2	YLR057W	NUT1	P53114	1132 aa		2.95	□□□□□ -1.94

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