RNA–Protein interactions for RNA: YHR083W

SAM35, Transcript of Component of the sorting and assembly machinery (SAM) complex, yeast

Gene SAM35, Length 990 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SAM35	YHR083W	YNL193W	P53870	558 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.25	□□□□□ -0.61	not detected
SAM35	YHR083W	NPA3	P47122	385 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	ARP5	P53946	755 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	HPC2	Q01448	625 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	BDF2	Q07442	638 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	PSF3	Q12146	194 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	UBX2	Q04228	584 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	YPR148C	Q06523	435 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	AI2	P03876	854 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	MET1	P36150	593 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	YHL017W	P38745	532 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	YKE2	P52553	114 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	IRC3	Q06683	689 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	TAH18	Q12181	623 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	CYB2	P00175	591 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	HRQ1	Q05549	1077 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	PEP3	P27801	918 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	IOC3	P43596	787 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	BBC1	P47068	1157 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	THI3	Q07471	609 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SAM35	YHR083W	UGA2	P38067	497 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	IRC8	P47046	822 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	PIB2	P53191	635 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	SAS4	Q04003	481 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	CTI6	Q08923	506 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	MGM1	P32266	881 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	TOS1	P38288	455 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	CWH41	P53008	833 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	ELG1	Q12050	791 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	11.18	□□□□□ -0.62	not detected
SAM35	YHR083W	ICP55	P40051	511 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	PFF1	P38244	976 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	BUD6	P41697	788 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	YGL081W	P53156	320 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	PEX19	Q07418	342 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	MPH3	P0CE00	602 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	TAF13	P11747	167 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	SIT4	P20604	311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	RPN12	P32496	274 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	CIR1	P42940	261 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	CTF18	P49956	741 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	FAR11	P53917	953 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	LCD1	Q04377	747 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	PRI1	P10363	409 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	IMP2'	P32351	346 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	FBP26	P32604	452 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	ELM1	P32801	640 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	YPL150W	Q12152	901 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SAM35	YHR083W	LAM4	P38800	1345 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	KAR5	Q04746	504 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	VID28	P40547	921 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	CTH1	P47976	325 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	EST2	Q06163	884 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	FIG2	P25653	1609 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	YBL086C	P38177	466 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	INM2	Q05533	292 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	KRE2	P27809	442 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	ERO1	Q03103	563 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.1	□□□□□ -0.63	not detected
SAM35	YHR083W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	ASF1	P32447	279 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	RER2	P35196	286 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	RKM3	P38222	552 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	ALG2	P43636	503 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	JJJ2	P46997	583 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	RSC1	P53236	928 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SAM35	YHR083W	CBP3	P21560	335 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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