RNA–Protein interactions for RNA: YHR016C

YSC84, Transcript of Actin-binding protein, yeast

Gene YSC84, Length 1,407 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YSC84	YHR016C	MRPL10	P36520	322 aa		13.6	□□□□□ -0.23
YSC84	YHR016C	EPS1	P40557	701 aa		13.6	□□□□□ -0.23
YSC84	YHR016C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
YSC84	YHR016C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
YSC84	YHR016C	MTC5	Q03897	1148 aa		13.59	□□□□□ -0.23
YSC84	YHR016C	BUG1	Q12191	341 aa		13.59	□□□□□ -0.23
YSC84	YHR016C	GYP5	Q12344	894 aa		13.59	□□□□□ -0.23
YSC84	YHR016C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
YSC84	YHR016C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	FCP1	Q03254	732 aa		13.58	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	YPL150W	Q12152	901 aa		13.58	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	TAF13	P11747	167 aa		13.57	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	NPR3	P38742	1146 aa		13.57	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	PKH1	Q03407	766 aa		13.57	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	ELG1	Q12050	791 aa		13.57	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	DCD1	P06773	312 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	LEO1	P38439	464 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	ESC2	Q06340	456 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	NYV1	Q12255	253 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	UGA2	P38067	497 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	SSL2	Q00578	843 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	PSK2	Q08217	1101 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	AI2	P03876	854 aa		13.55	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	VID28	P40547	921 aa		13.55	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	RDS1	P25611	832 aa		13.54	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	ENT3	P47160	408 aa		13.54	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	ARP5	P53946	755 aa		13.54	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	TRS33	Q99394	268 aa		13.54	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	CYC8	P14922	966 aa		13.53	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	PBY1	P38254	753 aa		13.53	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
YSC84	YHR016C	ATE1	P16639	503 aa		13.52	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	YHL017W	P38745	532 aa		13.52	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	ALD3	P54114	506 aa		13.52	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	UBP16	Q02863	499 aa		13.52	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	YGL082W	P53155	381 aa		13.51	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		13.5	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		13.5	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	OPI1	P21957	404 aa		13.5	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	MAL33	P38157	468 aa		13.5	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	STU2	P46675	888 aa		13.5	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	TIM50	Q02776	476 aa		13.49	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	SAC3	P46674	1301 aa		13.49	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	FBP26	P32604	452 aa		13.48	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	TPM2	P40414	161 aa		13.48	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	YKE2	P52553	114 aa		13.48	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	YNL193W	P53870	558 aa		13.48	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	ECM23	Q02710	187 aa		13.48	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	SGD1	Q06132	899 aa		13.48	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	TOS1	P38288	455 aa		13.47	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	PEP3	P27801	918 aa		13.47	□□□□□ -0.25
YSC84	YHR016C	LAM4	P38800	1345 aa		13.46	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	RFC5	P38251	354 aa		13.46	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	BBC1	P47068	1157 aa		13.46	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	YLR407W	Q06070	228 aa		13.46	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	GPA1	P08539	472 aa		13.45	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	ADR1	P07248	1323 aa		13.44	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	YER130C	P39959	443 aa		13.44	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	YPT11	P48559	417 aa		13.44	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	HPC2	Q01448	625 aa		13.43	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	CTI6	Q08923	506 aa		13.43	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	IMP2'	P32351	346 aa		13.42	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	BUD6	P41697	788 aa		13.42	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	MNR2	P35724	969 aa		13.4	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	RRM3	P38766	723 aa		13.4	□□□□□ -0.26
YSC84	YHR016C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
YSC84	YHR016C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.39	□□□□□ -0.27	not detected
YSC84	YHR016C	FYV10	P40492	516 aa		13.39	□□□□□ -0.27
YSC84	YHR016C	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
YSC84	YHR016C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
YSC84	YHR016C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
YSC84	YHR016C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
YSC84	YHR016C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
YSC84	YHR016C	TAH18	Q12181	623 aa		13.38	□□□□□ -0.27
YSC84	YHR016C	HAT1	Q12341	374 aa		13.38	□□□□□ -0.27
YSC84	YHR016C	POM152	P39685	1337 aa		13.37	□□□□□ -0.27
YSC84	YHR016C	GSY2	P27472	705 aa		13.37	□□□□□ -0.27
YSC84	YHR016C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 75.9 ms