RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000142312.2

Hoxd11-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd11, Length 1,111 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Slc52a2Q9D8F3 450 aa30,66■■■□□ 2,5
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Col14a1Q80X19 1797 aa30,62■■■□□ 2,49
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP30,6■■■□□ 2,49
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kdm2aP59997 1161 aa30,6■■■□□ 2,49
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 KdrP35918 1367 aa30,59■■■□□ 2,49
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Os9Q8K2C7 672 aa30,59■■■□□ 2,49
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 C3P01027 1663 aa30,58■■■□□ 2,49
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kif24Q6NWW5 1356 aa30,57■■■□□ 2,48
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP30,56■■■□□ 2,48
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP30,55■■■□□ 2,48
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Abcc10Q8R4P9 1501 aa30,55■■■□□ 2,48
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa30,54■■■□□ 2,48
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa30,54■■■□□ 2,48
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cps1Q8C196 1500 aa30,52■■■□□ 2,48
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gm20521D3Z5F7 333 aa30,52■■■□□ 2,48
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Fan1Q69ZT1 1020 aa30,52■■■□□ 2,48
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP30,5■■■□□ 2,47
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ift172Q6VH22 1749 aa30,49■■■□□ 2,47
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 NalcnQ8BXR5 1738 aa30,48■■■□□ 2,47
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP30,48■■■□□ 2,47
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP30,47■■■□□ 2,47
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Neurod1Q60867 357 aa30,46■■■□□ 2,47
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP30,46■■■□□ 2,47
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Emilin2Q8K482 1074 aa30,46■■■□□ 2,47
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Stk26Q99JT2 416 aa30,46■■■□□ 2,47
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Lrrc7Q80TE7 1490 aa30,45■■■□□ 2,47
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Polr3aB2RXC6 1390 aa30,45■■■□□ 2,47
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa30,42■■■□□ 2,46
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP30,41■■■□□ 2,46
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 GnpatP98192 678 aa30,39■■■□□ 2,46
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Smim5Q8BT42 78 aa30,38■■■□□ 2,45
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Col22a1E9Q7P1 1613 aa30,36■■■□□ 2,45
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Plekhg1F6S200 1446 aa30,35■■■□□ 2,45
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP30,35■■■□□ 2,45
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP30,34■■■□□ 2,45
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cep170bQ80U49 1574 aa30,34■■■□□ 2,45
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Eno4Q8C042 619 aa30,34■■■□□ 2,45
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Mug2P28666 1451 aa30,33■■■□□ 2,45
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 IqubQ8CDK3 788 aa30,33■■■□□ 2,45
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa30,31■■■□□ 2,44
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 DccP70211 1447 aa30,3■■■□□ 2,44
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Tex14Q7M6U3 1450 aa30,3■■■□□ 2,44
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa30,29■■■□□ 2,44
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa30,27■■■□□ 2,44
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Usp32F8VPZ3 1604 aa30,27■■■□□ 2,44
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 NefmP08553 848 aa30,27■■■□□ 2,44
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gm10563F6WIE4 79 aa30,26■■■□□ 2,43
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Q3UJC8 639 aa30,26■■■□□ 2,43
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Usp40Q8BWR4 1235 aa30,26■■■□□ 2,43
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Stag3O70576 1240 aa30,24■■■□□ 2,43
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP30,24■■■□□ 2,43
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Farp2Q91VS8 1065 aa30,23■■■□□ 2,43
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP30,23■■■□□ 2,43
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa30,22■■■□□ 2,43
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Nphp4P59240 1425 aa30,22■■■□□ 2,43
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa30,21■■■□□ 2,43
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Stard8Q8K031 1019 aa30,21■■■□□ 2,43
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP30,2■■■□□ 2,43
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Abca14E9Q8F8 1683 aa30,2■■■□□ 2,42
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kcna6Q61923 529 aa30,19■■■□□ 2,42
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 TonslQ6NZL6 1363 aa30,17■■■□□ 2,42
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Wnk3Q80XP9 1757 aa30,17■■■□□ 2,42
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Robo1O89026 1612 aa30,17■■■□□ 2,42
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 InhbeO08717 350 aa30,16■■■□□ 2,42
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Acsbg1Q99PU5 721 aa30,16■■■□□ 2,42
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa30,15■■■□□ 2,42
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa30,15■■■□□ 2,42
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 C5P06684 1680 aa30,14■■■□□ 2,42
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ccdc6D3YZP9 469 aa30,13■■■□□ 2,41
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP30,13■■■□□ 2,41
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Als2Q920R0 1651 aa30,12■■■□□ 2,41
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rundc1Q0VDN7 615 aa30,1■■■□□ 2,41
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Mink1Q9JM52 1308 aa30,1■■■□□ 2,41
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa30,09■■■□□ 2,41
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP30,09■■■□□ 2,41
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Srcin1Q9QWI6 1250 aa30,09■■■□□ 2,41
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Card11Q8CIS0 1159 aa30,06■■■□□ 2,4
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Fam135bQ9DAI6 1403 aa30,05■■■□□ 2,4
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa30,04■■■□□ 2,4
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Psrc1Q9D0P7 329 aa30,04■■■□□ 2,4
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 CenpjQ569L8 1344 aa30,01■■■□□ 2,4
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Zbtb4Q5F293 982 aa29,98■■■□□ 2,39
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Sugp2Q8CH09 1067 aa29,97■■■□□ 2,39
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Sirt1Q923E4 737 aa29,97■■■□□ 2,39
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pola1P33609 1465 aa29,95■■■□□ 2,39
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rock2P70336 1388 aa29,95■■■□□ 2,39
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Tnks1bp1P58871 1720 aa29,95■■■□□ 2,38
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cdk19Q8BWD8 501 aa29,94■■■□□ 2,38
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa29,94■■■□□ 2,38
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 NktrP30415 1453 aa29,93■■■□□ 2,38
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Atp7bQ64446 1462 aa29,93■■■□□ 2,38
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Idi1P58044 227 aa29,93■■■□□ 2,38
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Tmem2Q5FWI3 1383 aa29,92■■■□□ 2,38
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP29,92■■■□□ 2,38
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP29,92■■■□□ 2,38
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Sox12Q04890 314 aa29,92■■■□□ 2,38
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Camta1A2A891 1682 aa29,91■■■□□ 2,38
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kif1aP33173 1695 aa29,91■■■□□ 2,38
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP29,9■■■□□ 2,38
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 OscarQ8VBT3 265 aa29,89■■■□□ 2,38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26,9 ms