RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109698.8

Sh3bp1-204, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slit3Q9WVB4 1523 aa27.02■■□□□ 1.92
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Abca14E9Q8F8 1683 aa27.02■■□□□ 1.92
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 KdrP35918 1367 aa27.01■■□□□ 1.91
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa27.01■■□□□ 1.91
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Psme1P97371 249 aa27■■□□□ 1.91
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Txndc2Q6P902 515 aa27■■□□□ 1.91
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zscan21Q07231 555 aa26.98■■□□□ 1.91
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nwd1A6H603 1563 aa26.98■■□□□ 1.91
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa26.96■■□□□ 1.91
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa26.96■■□□□ 1.91
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kif7B7ZNG0 1348 aa26.95■■□□□ 1.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nrxn1Q9CS84 1514 aa26.95■■□□□ 1.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 NktrP30415 1453 aa26.94■■□□□ 1.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cps1Q8C196 1500 aa26.92■■□□□ 1.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Atf7ipQ7TT18 1306 aa26.92■■□□□ 1.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa26.91■■□□□ 1.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Arap3Q8R5G7 1538 aa26.91■■□□□ 1.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Q7TT23 1179 aa26.91■■□□□ 1.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dcaf11Q91VU6 549 aa26.91■■□□□ 1.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pik3r4Q8VD65 1358 aa26.91■■□□□ 1.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa26.9■■□□□ 1.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PzpQ61838 1495 aa26.9■■□□□ 1.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mink1Q9JM52 1308 aa26.89■■□□□ 1.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gsto1O09131 240 aa26.88■■□□□ 1.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cnga1P29974 684 aa26.87■■□□□ 1.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Asxl2Q8BZ32 1370 aa26.87■■□□□ 1.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Adgrl1Q80TR1 1466 aa26.86■■□□□ 1.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Alpk3Q924C5 1678 aa26.84■■□□□ 1.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 FanciQ8K368 1330 aa26.84■■□□□ 1.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 IghaA0A0A6YXW6 389 aa26.84■■□□□ 1.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cdk19Q8BWD8 501 aa26.83■■□□□ 1.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Usp32F8VPZ3 1604 aa26.78■■□□□ 1.88
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ofd1Q80Z25 1017 aa26.77■■□□□ 1.88
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Topaz1E5FYH1 1653 aa26.76■■□□□ 1.87
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa26.71■■□□□ 1.87
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nlrp6Q91WS2 869 aa26.7■■□□□ 1.86
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zranb1Q7M760 708 aa26.69■■□□□ 1.86
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 MyclP10166 368 aa26.68■■□□□ 1.86
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sirt1Q923E4 737 aa26.68■■□□□ 1.86
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PtpruB1AUH1 1446 aa26.67■■□□□ 1.86
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Map3k19E9Q3S4 1311 aa26.65■■□□□ 1.86
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 NinlQ6ZQ12 1394 aa26.64■■□□□ 1.86
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa26.64■■□□□ 1.85
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Csrnp3P59055 597 aa26.63■■□□□ 1.85
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Idi2Q8BFZ6 227 aa26.63■■□□□ 1.85
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Esx1O88933 382 aa26.62■■□□□ 1.85
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rims2Q9EQZ7 1530 aa26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa26.6■■□□□ 1.85
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kif1aP33173 1695 aa26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Q3UJC8 639 aa26.57■■□□□ 1.84
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Med1Q925J9 1575 aa26.55■■□□□ 1.84
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 C5P06684 1680 aa26.55■■□□□ 1.84
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Als2Q920R0 1651 aa26.54■■□□□ 1.84
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kank1E9Q238 1360 aa26.53■■□□□ 1.84
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Usp19Q3UJD6 1360 aa26.53■■□□□ 1.84
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CatipB9EKE5 520 aa26.53■■□□□ 1.84
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 GsdmaQ9EST1 446 aa26.53■■□□□ 1.84
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P2rx7Q9Z1M0 595 aa26.53■■□□□ 1.84
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Znf335A2A5K6 1337 aa26.5■■□□□ 1.83
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mon2Q80TL7 1715 aa26.5■■□□□ 1.83
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kif16bB1AVY7 1312 aa26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Golga2Q921M4 999 aa26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa26.48■■□□□ 1.83
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Calr4Q3TQS0 420 aa26.47■■□□□ 1.83
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Abcc10Q8R4P9 1501 aa26.46■■□□□ 1.83
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ttc41Q692V3 1318 aa26.46■■□□□ 1.83
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 L3mbtl2P59178 703 aa26.46■■□□□ 1.83
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Uspl1Q3ULM6 1089 aa26.45■■□□□ 1.82
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Iqsec2Q5DU25 1478 aa26.45■■□□□ 1.82
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa26.44■■□□□ 1.82
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CrbnQ8C7D2 445 aa26.43■■□□□ 1.82
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Znf316Q6PGE4 1016 aa26.41■■□□□ 1.82
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hoxb7P09024 217 aa26.41■■□□□ 1.82
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mdc1Q5PSV9 1707 aa26.41■■□□□ 1.82
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa26.4■■□□□ 1.82
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trim28Q62318 834 aa26.4■■□□□ 1.82
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Astn2Q80Z10 1352 aa26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.8 ms