RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063116.9

Msx1-201, Transcript of Homeobox protein MSX-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Msx1, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slit3Q9WVB4 1523 aa26.64■■□□□ 1.86
Msx1-201ENSMUST00000063116 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa26.63■■□□□ 1.85
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nwd1A6H603 1563 aa26.61■■□□□ 1.85
Msx1-201ENSMUST00000063116 Bcl9Q9D219 1425 aa26.61■■□□□ 1.85
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cnga1P29974 684 aa26.61■■□□□ 1.85
Msx1-201ENSMUST00000063116 NrdcQ8BHG1 1161 aa26.59■■□□□ 1.85
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mink1Q9JM52 1308 aa26.59■■□□□ 1.85
Msx1-201ENSMUST00000063116 NktrP30415 1453 aa26.58■■□□□ 1.85
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tex14Q7M6U3 1450 aa26.58■■□□□ 1.85
Msx1-201ENSMUST00000063116 Q7TT23 1179 aa26.56■■□□□ 1.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa26.55■■□□□ 1.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa26.53■■□□□ 1.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zranb1Q7M760 708 aa26.53■■□□□ 1.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa26.52■■□□□ 1.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kif7B7ZNG0 1348 aa26.52■■□□□ 1.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cps1Q8C196 1500 aa26.52■■□□□ 1.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Topaz1E5FYH1 1653 aa26.51■■□□□ 1.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dcaf11Q91VU6 549 aa26.51■■□□□ 1.83
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tnnt3Q9QZ47 272 aa26.5■■□□□ 1.83
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nrxn1Q9CS84 1514 aa26.5■■□□□ 1.83
Msx1-201ENSMUST00000063116 PzpQ61838 1495 aa26.49■■□□□ 1.83
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa26.49■■□□□ 1.83
Msx1-201ENSMUST00000063116 Usp32F8VPZ3 1604 aa26.49■■□□□ 1.83
Msx1-201ENSMUST00000063116 MyclP10166 368 aa26.49■■□□□ 1.83
Msx1-201ENSMUST00000063116 Arap3Q8R5G7 1538 aa26.48■■□□□ 1.83
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cdk19Q8BWD8 501 aa26.47■■□□□ 1.83
Msx1-201ENSMUST00000063116 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zscan21Q07231 555 aa26.44■■□□□ 1.82
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gsto1O09131 240 aa26.43■■□□□ 1.82
Msx1-201ENSMUST00000063116 KdrP35918 1367 aa26.43■■□□□ 1.82
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pik3r4Q8VD65 1358 aa26.42■■□□□ 1.82
Msx1-201ENSMUST00000063116 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa26.41■■□□□ 1.82
Msx1-201ENSMUST00000063116 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa26.4■■□□□ 1.82
Msx1-201ENSMUST00000063116 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
Msx1-201ENSMUST00000063116 Adgrl1Q80TR1 1466 aa26.39■■□□□ 1.82
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa26.38■■□□□ 1.81
Msx1-201ENSMUST00000063116 Csrnp3P59055 597 aa26.37■■□□□ 1.81
Msx1-201ENSMUST00000063116 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
Msx1-201ENSMUST00000063116 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atf7ipQ7TT18 1306 aa26.34■■□□□ 1.81
Msx1-201ENSMUST00000063116 FanciQ8K368 1330 aa26.32■■□□□ 1.8
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
Msx1-201ENSMUST00000063116 Map3k19E9Q3S4 1311 aa26.3■■□□□ 1.8
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa26.3■■□□□ 1.8
Msx1-201ENSMUST00000063116 NinlQ6ZQ12 1394 aa26.29■■□□□ 1.8
Msx1-201ENSMUST00000063116 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa26.28■■□□□ 1.8
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ofd1Q80Z25 1017 aa26.25■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 P2rx7Q9Z1M0 595 aa26.24■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 PtpruB1AUH1 1446 aa26.23■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 Esx1O88933 382 aa26.23■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa26.22■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 Q3UJC8 639 aa26.22■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rims2Q9EQZ7 1530 aa26.21■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nlrp6Q91WS2 869 aa26.21■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 Idi2Q8BFZ6 227 aa26.2■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 C5P06684 1680 aa26.2■■□□□ 1.78
Msx1-201ENSMUST00000063116 Znf316Q6PGE4 1016 aa26.2■■□□□ 1.78
Msx1-201ENSMUST00000063116 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa26.19■■□□□ 1.78
Msx1-201ENSMUST00000063116 Als2Q920R0 1651 aa26.19■■□□□ 1.78
Msx1-201ENSMUST00000063116 Med1Q925J9 1575 aa26.18■■□□□ 1.78
Msx1-201ENSMUST00000063116 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa26.17■■□□□ 1.78
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sirt1Q923E4 737 aa26.17■■□□□ 1.78
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
Msx1-201ENSMUST00000063116 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kif1aP33173 1695 aa26.13■■□□□ 1.77
Msx1-201ENSMUST00000063116 Usp19Q3UJD6 1360 aa26.12■■□□□ 1.77
Msx1-201ENSMUST00000063116 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
Msx1-201ENSMUST00000063116 Abcc10Q8R4P9 1501 aa26.1■■□□□ 1.77
Msx1-201ENSMUST00000063116 CatipB9EKE5 520 aa26.1■■□□□ 1.77
Msx1-201ENSMUST00000063116 NalcnQ8BXR5 1738 aa26.08■■□□□ 1.77
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mon2Q80TL7 1715 aa26.08■■□□□ 1.77
Msx1-201ENSMUST00000063116 Aplp2Q06335 707 aa26.07■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa26.06■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kif16bB1AVY7 1312 aa26.06■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tmem94Q7TSH8 1360 aa26.06■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Brwd3A2AHJ4 1799 aa26.06■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Iqsec2Q5DU25 1478 aa26.06■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 C3P01027 1663 aa26.06■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 GsdmaQ9EST1 446 aa26.05■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Col14a1Q80X19 1797 aa26.04■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 L3mbtl2P59178 703 aa26.04■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm10563F6WIE4 79 aa26.04■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 CrbnQ8C7D2 445 aa26.04■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Idi1P58044 227 aa26.03■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tns3Q5SSZ5 1440 aa26.03■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Scn4aQ9ER60 1841 aa26.01■■□□□ 1.75
Msx1-201ENSMUST00000063116 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa26■■□□□ 1.75
Msx1-201ENSMUST00000063116 Golga2Q921M4 999 aa26■■□□□ 1.75
Msx1-201ENSMUST00000063116 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
Msx1-201ENSMUST00000063116 Uspl1Q3ULM6 1089 aa25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 76.1 ms