RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063116.9

Msx1-201, Transcript of Homeobox protein MSX-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Msx1, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slit3Q9WVB4 1523 aa26.64■■□□□ 1.86
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Msx1-201ENSMUST00000063116 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa26.63■■□□□ 1.85
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nwd1A6H603 1563 aa26.61■■□□□ 1.85
Msx1-201ENSMUST00000063116 Bcl9Q9D219 1425 aa26.61■■□□□ 1.85
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cnga1P29974 684 aa26.61■■□□□ 1.85
Msx1-201ENSMUST00000063116 NrdcQ8BHG1 1161 aa26.59■■□□□ 1.85
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mink1Q9JM52 1308 aa26.59■■□□□ 1.85
Msx1-201ENSMUST00000063116 NktrP30415 1453 aa26.58■■□□□ 1.85
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tex14Q7M6U3 1450 aa26.58■■□□□ 1.85
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Msx1-201ENSMUST00000063116 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa26.55■■□□□ 1.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa26.53■■□□□ 1.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zranb1Q7M760 708 aa26.53■■□□□ 1.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa26.52■■□□□ 1.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kif7B7ZNG0 1348 aa26.52■■□□□ 1.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cps1Q8C196 1500 aa26.52■■□□□ 1.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Topaz1E5FYH1 1653 aa26.51■■□□□ 1.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dcaf11Q91VU6 549 aa26.51■■□□□ 1.83
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tnnt3Q9QZ47 272 aa26.5■■□□□ 1.83
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nrxn1Q9CS84 1514 aa26.5■■□□□ 1.83
Msx1-201ENSMUST00000063116 PzpQ61838 1495 aa26.49■■□□□ 1.83
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa26.49■■□□□ 1.83
Msx1-201ENSMUST00000063116 Usp32F8VPZ3 1604 aa26.49■■□□□ 1.83
Msx1-201ENSMUST00000063116 MyclP10166 368 aa26.49■■□□□ 1.83
Msx1-201ENSMUST00000063116 Arap3Q8R5G7 1538 aa26.48■■□□□ 1.83
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cdk19Q8BWD8 501 aa26.47■■□□□ 1.83
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Msx1-201ENSMUST00000063116 Zscan21Q07231 555 aa26.44■■□□□ 1.82
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gsto1O09131 240 aa26.43■■□□□ 1.82
Msx1-201ENSMUST00000063116 KdrP35918 1367 aa26.43■■□□□ 1.82
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pik3r4Q8VD65 1358 aa26.42■■□□□ 1.82
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Msx1-201ENSMUST00000063116 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa26.41■■□□□ 1.82
Msx1-201ENSMUST00000063116 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa26.4■■□□□ 1.82
Msx1-201ENSMUST00000063116 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
Msx1-201ENSMUST00000063116 Adgrl1Q80TR1 1466 aa26.39■■□□□ 1.82
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa26.38■■□□□ 1.81
Msx1-201ENSMUST00000063116 Csrnp3P59055 597 aa26.37■■□□□ 1.81
Msx1-201ENSMUST00000063116 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
Msx1-201ENSMUST00000063116 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atf7ipQ7TT18 1306 aa26.34■■□□□ 1.81
Msx1-201ENSMUST00000063116 FanciQ8K368 1330 aa26.32■■□□□ 1.8
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
Msx1-201ENSMUST00000063116 Map3k19E9Q3S4 1311 aa26.3■■□□□ 1.8
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa26.3■■□□□ 1.8
Msx1-201ENSMUST00000063116 NinlQ6ZQ12 1394 aa26.29■■□□□ 1.8
Msx1-201ENSMUST00000063116 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa26.28■■□□□ 1.8
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ofd1Q80Z25 1017 aa26.25■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 P2rx7Q9Z1M0 595 aa26.24■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 PtpruB1AUH1 1446 aa26.23■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 Esx1O88933 382 aa26.23■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa26.22■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 Q3UJC8 639 aa26.22■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rims2Q9EQZ7 1530 aa26.21■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nlrp6Q91WS2 869 aa26.21■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 Idi2Q8BFZ6 227 aa26.2■■□□□ 1.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 C5P06684 1680 aa26.2■■□□□ 1.78
Msx1-201ENSMUST00000063116 Znf316Q6PGE4 1016 aa26.2■■□□□ 1.78
Msx1-201ENSMUST00000063116 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa26.19■■□□□ 1.78
Msx1-201ENSMUST00000063116 Als2Q920R0 1651 aa26.19■■□□□ 1.78
Msx1-201ENSMUST00000063116 Med1Q925J9 1575 aa26.18■■□□□ 1.78
Msx1-201ENSMUST00000063116 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa26.17■■□□□ 1.78
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sirt1Q923E4 737 aa26.17■■□□□ 1.78
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
Msx1-201ENSMUST00000063116 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kif1aP33173 1695 aa26.13■■□□□ 1.77
Msx1-201ENSMUST00000063116 Usp19Q3UJD6 1360 aa26.12■■□□□ 1.77
Msx1-201ENSMUST00000063116 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
Msx1-201ENSMUST00000063116 Abcc10Q8R4P9 1501 aa26.1■■□□□ 1.77
Msx1-201ENSMUST00000063116 CatipB9EKE5 520 aa26.1■■□□□ 1.77
Msx1-201ENSMUST00000063116 NalcnQ8BXR5 1738 aa26.08■■□□□ 1.77
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mon2Q80TL7 1715 aa26.08■■□□□ 1.77
Msx1-201ENSMUST00000063116 Aplp2Q06335 707 aa26.07■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa26.06■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kif16bB1AVY7 1312 aa26.06■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tmem94Q7TSH8 1360 aa26.06■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Brwd3A2AHJ4 1799 aa26.06■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Iqsec2Q5DU25 1478 aa26.06■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 C3P01027 1663 aa26.06■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 GsdmaQ9EST1 446 aa26.05■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Col14a1Q80X19 1797 aa26.04■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 L3mbtl2P59178 703 aa26.04■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm10563F6WIE4 79 aa26.04■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 CrbnQ8C7D2 445 aa26.04■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Idi1P58044 227 aa26.03■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tns3Q5SSZ5 1440 aa26.03■■□□□ 1.76
Msx1-201ENSMUST00000063116 Scn4aQ9ER60 1841 aa26.01■■□□□ 1.75
Msx1-201ENSMUST00000063116 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa26■■□□□ 1.75
Msx1-201ENSMUST00000063116 Golga2Q921M4 999 aa26■■□□□ 1.75
Msx1-201ENSMUST00000063116 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
Msx1-201ENSMUST00000063116 Uspl1Q3ULM6 1089 aa25.98■■□□□ 1.75
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