RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 PTK6Q13882 451 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 IPMKQ8NFU5 416 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 MDM1Q8TC05 714 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 AGBL1Q96MI9 1066 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ECSITQ9BQ95 431 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TJP1Q07157 1748 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SUPT3HB4E1H0 165 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB39O15060 712 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 P4HA2O15460 535 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC26A4O43511 780 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TCF3P15923 654 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 STIP1P31948 543 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPN7P35236 360 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 HSPA13P48723 471 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 FNTAP49354 379 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 GTF2H3Q13889 308 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PCSK7Q16549 785 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM16LQ309B1 348 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 BOLA3Q53S33 107 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 DENND1BQ6P3S1 775 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CYB5D1Q6P9G0 228 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 HORMAD1Q86X24 394 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PPIL6Q8IXY8 311 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SH3GL2Q99962 352 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM8AQ9HCN3 771 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 DTNAQ9Y4J8 743 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 RASSF9O75901 435 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 HSD17B3P37058 310 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 COILP38432 576 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 COG2Q14746 738 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 IL31Q6EBC2 164 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 FEZF2Q8TBJ5 459 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 NR3C2P08235 984 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 MYBP10242 640 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 HMGCS2P54868 508 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TWF1Q12792 350 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM83EQ2M2I3 478 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ZCWPW2Q504Y3 356 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 GPAT2Q6NUI2 795 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC34Q8IZ02 419 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNB2Q92953 911 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SGF29Q96ES7 293 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHB8Q9UN66 801 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 E2F8A0AVK6 867 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB22O15209 634 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ALDH1A1P00352 501 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 APOA4P06727 396 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 RALBP11234 206 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 RPA1P27694 616 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ACADSBP45954 432 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 NUDT2P50583 147 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 MAPK7Q13164 816 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAF7Q6Q0C0 670 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF677Q86XU0 584 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM49BQ9NUQ9 324 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 AP4S1Q9Y587 144 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 V9GYQ6 96 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TNS2Q63HR2 1409 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 LRP6O75581 1613 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGEA13PA6NCF6 341 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TRPC5OSA6NMA1 111 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGEB2O15479 319 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PCSK1P29120 753 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ST8SIA6P61647 398 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 RCN1Q15293 331 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SMTNL2Q2TAL5 461 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 DCAF6Q58WW2 860 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC81Q6ZN84 652 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SEPT12Q8IYM1 358 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM111AQ96PZ2 611 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 USE1Q9NZ43 259 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 NAGPAQ9UK23 515 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SOX13Q9UN79 622 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 GUCA1CO95843 209 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CHRM3P20309 590 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC15Q0P6D6 951 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SGO1Q5FBB7 561 aa11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms