RNA–Protein interactions for RNA: YLL058W

YLL058W, Transcript of Putative protein of unknown function with similarity to Str2p, yeast

Gene YLL058W, Length 1,728 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL058W	YLL058W	YGR149W	P48236	432 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	PAI3	P01094	68 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	RPS23B	P0CX30	145 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	UBC5	P15732	148 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	MIG1	P27705	504 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	YKL107W	P34251	309 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	SPC25	P40014	221 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	VMA21	P41806	77 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	YGL230C	P53074	147 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	APJ1	P53940	528 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	CTR3	Q06686	241 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	NAT5	Q08689	176 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	RPB7	P34087	171 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	SWM2	P40342	146 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	OST3	P48439	350 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	GPI15	P53961	229 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	RPL12B	P0CX54	165 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	ANB1	P19211	157 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	MRS4	P23500	304 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	MRP17	P28778	131 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	MIC26	P50087	233 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	HSK3	P69852	69 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	INO4	P13902	151 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	HNT2	P49775	206 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	YGL262W	P53054	175 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	WSC2	P53832	503 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	ATG40	Q99325	256 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	PHO85	P17157	305 aa		5.71	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	UTR5	P32630	166 aa		5.71	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	AIM11	P87275	137 aa		5.71	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	FIT1	Q04433	528 aa		5.71	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	YMR254C	Q04838	102 aa		5.71	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		5.71	□□□□□ -1.49
YLL058W	YLL058W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	HMRA1	P0CY11	126 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	YFL015C	P43578	164 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	RFM1	Q12192	310 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	ACB1	P31787	87 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	VHS2	P40463	436 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	PRM5	P40476	318 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	PIR5	P46999	287 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	UPS1	Q05776	175 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	PAU23	Q07987	124 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	PAU17	Q12370	124 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	BPH1	P25356	2167 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	COX10	P21592	462 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	YCR007C	P25354	239 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	YFL065C	P43539	102 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	SBH1	P52870	82 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	SOR2	Q07786	357 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	PRM3	Q08931	133 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	YPR203W	Q08994	102 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	ERG2	P32352	222 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	YIL059C	P40520	121 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	YGR219W	P53307	113 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	RIM9	Q04734	239 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	LOA1	Q06508	300 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	CDC43	P18898	376 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	NCE103	P53615	221 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	YNL046W	P53956	172 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	ASM4	Q05166	528 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	RRT7	Q07829	113 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	YLR042C	Q07990	161 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	TEM1	P38987	245 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	ZRT1	P32804	376 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YLL058W	YLL058W	NCA3	P46955	337 aa		5.66	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39.5 ms