RNA–Protein interactions for RNA: YGL008C

PMA1, Transcript of Plasma membrane P2-type H+-ATPase, yeast

Gene PMA1, Length 2,757 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMA1	YGL008C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	MRS4	P23500	304 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	ECM34	P38728	170 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	EMC5	P40540	141 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	TDA4	P47153	279 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	TVP18	Q04767	167 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	YMR253C	Q04835	414 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	ATG5	Q12380	294 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	SGA1	P08019	549 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	ERV15	P38312	142 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	RPR2	P40571	144 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	RPE1	P46969	238 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	ERV14	P53173	138 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	APJ1	P53940	528 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	AYT1	Q12226	474 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	YPT53	P36019	220 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	SDH4	P37298	181 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	SWM2	P40342	146 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	PAU12	P53343	120 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	VPS28	Q02767	242 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	ODC2	Q99297	307 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	TRP1	P00912	224 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	YFL019C	P43576	117 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	YPL039W	Q03080	316 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	YPL162C	Q12042	273 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	MCP1	Q12106	302 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	YPR096C	O13587	100 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	FUN14	P18411	198 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	MSA2	P36157	363 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	SNM1	P40993	198 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	WSC2	P53832	503 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	IZH2	Q12442	317 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	MRPL44	P19956	98 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	ATP15	P21306	62 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	PAU2	P32612	120 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	MRPL15	P36523	253 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	YNR062C	P53748	327 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	EST3	Q03096	181 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	PIR1	Q03178	341 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	ATX2	Q12067	313 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PMA1	YGL008C	ATP5	P09457	212 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	TIR1	P10863	254 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	RNQ1	P25367	405 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	TVP23	P38962	199 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	YPR114W	Q06107	315 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	YDL211C	Q12121	372 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	YER188W	P40103	239 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	CFD1	P40558	293 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	YPR063C	Q12160	140 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	YOR015W	Q12169	119 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	HOT13	P36078	116 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
PMA1	YGL008C	YMR244W	Q04018	355 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	SEC59	P20048	519 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	YOR062C	P36025	268 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	FLX1	P40464	311 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	PRM5	P40476	318 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	SCW10	Q04951	389 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	CSI2	Q08054	341 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	OMA1	P36163	345 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	GEP7	P53171	287 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	IMP1	P28627	190 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	SRP21	P32342	167 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	YJL028W	P47062	111 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	PGU1	P47180	361 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	RSM10	Q03201	203 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	FSH2	Q05015	223 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	FLO5	P38894	1075 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	YAR029W	P39549	74 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	FCY1	Q12178	158 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	HUT1	Q12520	339 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	MOH1	P38191	138 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PMA1	YGL008C	AIM11	P87275	137 aa		4.11	□□□□□ -1.75

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