RNA–Protein interactions for RNA: YHR098C

SFB3, Transcript of Component of the Sec23p-Sfb3p heterodimer of the COPII vesicle coat, yeast

Gene SFB3, Length 2,790 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFB3	YHR098C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	XBP1	P40489	647 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
SFB3	YHR098C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	CDC43	P18898	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	YCR007C	P25354	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	YKL070W	P36087	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	PAM17	P36147	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	XPT1	P47165	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	COX18	P53239	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	RKI1	Q12189	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	ATO3	Q12359	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	NPC2	Q12408	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	CTA1	P15202	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	ERG2	P32352	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	YPS6	P40583	537 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	COQ11	Q05892	277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	SOR2	Q07786	357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	ATP10	P18496	279 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	MDH2	P22133	377 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	YJL163C	P46996	555 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SFB3	YHR098C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	PPA2	P28239	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	GPX1	P36014	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	YKL071W	P36086	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	COQ5	P49017	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	YOR105W	Q08504	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	OPI3	P05375	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	YPL039W	Q03080	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	SAG1	P20840	650 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	ICS2	P38284	255 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	CTK2	P46962	323 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	CAB4	P53332	305 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	BOR1	P53838	576 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	PET191	Q02772	108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	IRC13	Q08630	104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	YLR302C	O13544	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	YSR3	P23501	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	URK1	P27515	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
SFB3	YHR098C	BRR6	P53062	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	YNL092W	P53934	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	ROT1	Q03691	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	LDS2	Q08218	356 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	SRP14	P38985	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	SPG5	P42933	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	CRH1	P53301	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	GAL7	P08431	366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	ANS1	P38832	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	GPI2	P46961	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	LPP1	Q04396	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	RLM1	Q12224	676 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	CMC1	P36064	111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	YIL012W	P40551	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	AQR1	P53943	586 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	INO4	P13902	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	REC114	P32841	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	SHO1	P40073	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	YIL163C	P40448	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	PRM3	Q08931	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	USV1	Q12132	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	CUP2	P15315	225 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	TVP23	P38962	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	YMR007W	Q03675	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	YBR090C	P38253	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	TAE1	P38340	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	SAP30	P38429	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	THI72	Q08579	599 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFB3	YHR098C	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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