RNA–Protein interactions for RNA: YGR008C

STF2, Transcript of Protein involved in resistance to desiccation stress, yeast

Gene STF2, Length 255 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STF2	YGR008C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	MRPL35	Q06678	367 aa		0.4	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	YNG1	Q08465	219 aa		0.4	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	IES3	Q12345	250 aa		0.4	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	YHR213W	P0CI67	198 aa		0.39	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	PMR1	P13586	950 aa		0.39	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.39	□□□□□ -2.35	not detected
STF2	YGR008C	YBL059W	P34224	193 aa		0.39	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	YLF2	P38746	405 aa		0.39	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	HUA1	P40325	198 aa		0.39	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	AIM20	P40451	204 aa		0.39	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	SCM3	Q12334	223 aa		0.39	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	SAS5	Q99314	248 aa		0.39	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	VPS63	O13549	108 aa		0.38	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	RRT1	P38192	103 aa		0.38	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	MED8	P38304	223 aa		0.38	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	YBR285W	P38354	144 aa		0.38	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	DLS1	P40366	167 aa		0.38	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	GPI1	P53306	609 aa		0.38	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	YMR010W	Q03687	405 aa		0.38	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	YMR253C	Q04835	414 aa		0.38	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.38	□□□□□ -2.35	not detected
STF2	YGR008C	APC9	Q12107	265 aa		0.38	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		0.38	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	YLR302C	O13544	120 aa		0.37	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	FUN26	P31381	517 aa		0.37	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	PEX22	P39718	180 aa		0.37	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	LCB3	P47013	409 aa		0.37	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	YGR016W	P53209	190 aa		0.37	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	YGR025W	P53216	100 aa		0.37	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	SMP3	Q04174	516 aa		0.37	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	YMR320W	Q04897	101 aa		0.37	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		0.37	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	CDC50	P25656	391 aa		0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	ERG3	P32353	365 aa		0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	NUF2	P33895	451 aa		0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	YUH1	P35127	236 aa		0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	MID2	P36027	376 aa		0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	MRPL17	P36528	281 aa		0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	URB2	P47108	1174 aa		0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	MRM2	P53123	320 aa		0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	GPG1	P53130	126 aa		0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	USE1	P53146	245 aa		0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	SNA2	P56508	79 aa		0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	OST6	Q03723	332 aa		0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	MLC2	Q06580	163 aa		0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	YOL118C	Q08259	102 aa		0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	BOL1	Q3E793	110 aa		0.36	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	YCR022C	P25620	114 aa		0.35	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	DPB3	P27344	201 aa		0.35	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	SSO2	P39926	295 aa		0.35	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	EFM4	P40516	257 aa		0.35	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	DFG10	P40526	253 aa		0.35	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	SWP82	P43554	623 aa		0.35	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	DSL1	P53847	754 aa		0.35	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	HRD1	Q08109	551 aa		0.35	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	TRM10	Q12400	293 aa		0.35	□□□□□ -2.35
STF2	YGR008C	ECM12	O13529	151 aa		0.34	□□□□□ -2.36
STF2	YGR008C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
STF2	YGR008C	PHO80	P20052	293 aa		0.34	□□□□□ -2.36
STF2	YGR008C	MRPL25	P23369	157 aa		0.34	□□□□□ -2.36
STF2	YGR008C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
STF2	YGR008C	YHR022C	P38763	256 aa		0.34	□□□□□ -2.36
STF2	YGR008C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
STF2	YGR008C	ERG28	P40030	148 aa		0.34	□□□□□ -2.36
STF2	YGR008C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
STF2	YGR008C	DIE2	P50076	525 aa		0.34	□□□□□ -2.36
STF2	YGR008C	MGA1	P53050	456 aa		0.34	□□□□□ -2.36
STF2	YGR008C	POP6	P53218	158 aa		0.34	□□□□□ -2.36
STF2	YGR008C	ORM1	P53224	222 aa		0.34	□□□□□ -2.36
STF2	YGR008C	YGR168C	P53293	376 aa		0.34	□□□□□ -2.36
STF2	YGR008C	VPS75	P53853	264 aa		0.34	□□□□□ -2.36
STF2	YGR008C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
STF2	YGR008C	YOL160W	Q08321	113 aa		0.34	□□□□□ -2.36
STF2	YGR008C	YOR292C	Q08743	309 aa		0.34	□□□□□ -2.36
STF2	YGR008C	NFI1	Q12216	726 aa		0.34	□□□□□ -2.36
STF2	YGR008C	PCL9	Q12477	304 aa		0.34	□□□□□ -2.36

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 110 ms