RNA–Protein interactions for RNA: YLR167W

RPS31, Transcript of Fusion protein cleaved to yield ribosomal protein S31 and ubiquitin, yeast

Gene RPS31, Length 459 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS31	YLR167W	BOL2	P53082	120 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	AHC2	P25649	128 aa		3	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	KDX1	P36005	433 aa		3	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	AIM2	P39721	246 aa		3	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	SER2	P42941	309 aa		3	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	DAN1	P47178	298 aa		3	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	ERG25	P53045	309 aa		3	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	PGA1	P53896	198 aa		3	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	DYN3	Q04949	312 aa		3	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	DGA1	Q08650	418 aa		3	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	RKR1	Q04781	1562 aa		3	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	FES1	P38260	290 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	OPY1	P38271	328 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	NVJ1	P38881	321 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	YEA4	P40004	342 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	YDR274C	P87283	123 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	YOR093C	Q12275	1648 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	YIL177C	P40434	1758 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	YJL225C	P40889	1758 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	YHR022C	P38763	256 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	FCY21	P40039	528 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	YER134C	P40081	178 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	NUP49	Q02199	472 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	AIM34	Q03673	198 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	DDI2	P0CH63	225 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	DDI3	P0CH64	225 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	YNL217W	P40152	326 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	SHH4	Q06236	168 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	UFD4	P33202	1483 aa		2.96	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	YER076C	P40049	302 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	YER121W	P40076	114 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	YNR077C	P53758	84 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	CYT2	Q00873	224 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	GPI17	Q04080	534 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	ATG40	Q99325	256 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	NRG2	P38082	220 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	EAF6	P47128	113 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	PDR18	P53756	1333 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	YKL102C	P34249	101 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	DSE2	P38844	325 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	AGE2	P40529	298 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	NAT3	Q06504	195 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	TY2B-C	P25384	1770 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	NTE1	Q04958	1679 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	FZF1	P32805	299 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	TVP38	P36164	337 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	YBR209W	P38311	105 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	AVT2	P39981	480 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	BOL1	Q3E793	110 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	NSG1	P38837	291 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	MTW1	P39731	289 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	AYR1	P40471	297 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	MPC3	P53311	146 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	IGO1	P53897	168 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	PLP1	Q04004	230 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	YOL014W	Q08110	124 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	YOR342C	Q12182	319 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	PEX11	Q12462	236 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	ESP1	Q03018	1630 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	MDH2	P22133	377 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	2.91	□□□□□ -1.94	not detected
RPS31	YLR167W	YFL019C	P43576	117 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RPS31	YLR167W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95

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