RNA–Protein interactions for RNA: YKR065C

PAM17, Transcript of Constituent of the TIM23 complex, yeast

Gene PAM17, Length 594 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM17	YKR065C	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	ARG80	P07249	177 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	GCN3	P14741	305 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	LSB5	P25369	354 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	CTR2	P38865	189 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	PIR5	P46999	287 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	YGL114W	P53134	725 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	RIM9	Q04734	239 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	HRD1	Q08109	551 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	YNG1	Q08465	219 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	QCR2	P07257	368 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	PUT1	P09368	476 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	YLL053C	P0CD98	152 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	ECM31	P38122	312 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	POP8	P38208	133 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	COS8	P38723	381 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	PAM18	Q07914	168 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	CSI2	Q08054	341 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	YOR292C	Q08743	309 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PAM17	YKR065C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	SEN2	P16658	377 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	FIG1	P38224	298 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	RRF1	P38771	230 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	IKI1	P38874	309 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	NIF3	P53081	288 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	THI74	Q04083	370 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	YDR114C	Q04597	100 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	YPD1	Q07688	167 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	ISN1	Q99312	450 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	BPH1	P25356	2167 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	LPP1	Q04396	274 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	YCT1	Q12235	531 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	ATG31	Q12421	196 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	YMR31	P19955	123 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	SPS18	P32572	300 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	ERV15	P38312	142 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	YJL118W	P47022	219 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	YIP1	P53039	248 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	YFH1	Q07540	174 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	VPS63	O13549	108 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	PHO85	P17157	305 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	RPB9	P27999	122 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	ERG2	P32352	222 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	AGA2	P32781	87 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	PPQ1	P32945	549 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	SSO2	P39926	295 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	PCL7	P40186	285 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	TFC7	Q12415	435 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	ACB1	P31787	87 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	VMA11	P32842	164 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	YER188W	P40103	239 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	TSA2	Q04120	196 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	ROX3	P25046	220 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	PMU1	P36069	295 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	YGR210C	P42942	411 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	MRPL50	P53724	139 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	WSC2	P53832	503 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	YOR029W	Q12243	111 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	SRL3	P36167	246 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	ECM27	P47144	725 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	STD1	Q02794	444 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	BOL1	Q3E793	110 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	YOS1	Q3E834	85 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PAM17	YKR065C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	YIR035C	P40579	254 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	YJR056C	P47115	236 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	YGL262W	P53054	175 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	GPI15	P53961	229 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	MIX17	Q03667	156 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	YOL118C	Q08259	102 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	YJR012C	P47087	207 aa		5.88	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	VPS28	Q02767	242 aa		5.88	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47

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