RNA–Protein interactions for RNA: YPL179W

PPQ1, Transcript of Protein phosphatase that regulates the mating response, yeast

Gene PPQ1, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPQ1	YPL179W	THI74	Q04083	370 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	UPS1	Q05776	175 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	SWT1	Q12104	458 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	RFM1	Q12192	310 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	GAL1	P04385	528 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	PUT1	P09368	476 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	MRP17	P28778	131 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	SRL3	P36167	246 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	YGR210C	P42942	411 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	SOL1	P50278	321 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	NIF3	P53081	288 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	INN1	P53901	409 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	APJ1	P53940	528 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	HSK3	P69852	69 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	YPL067C	Q02754	198 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	GMC1	Q04399	608 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	FIT1	Q04433	528 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	YDR286C	Q05530	114 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	RTT103	Q05543	409 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	SCP1	Q08873	200 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	VAM3	Q12241	283 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	MED4	Q12343	284 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	ARG80	P07249	177 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	SPS4	P09937	338 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	GCN3	P14741	305 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	CKA1	P15790	372 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	YCR101C	P25607	182 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	ERG2	P32352	222 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	COS8	P38723	381 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.17	□□□□□ -1.9	not detected
PPQ1	YPL179W	POP2	P39008	433 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.17	□□□□□ -1.9	not detected
PPQ1	YPL179W	YIR020C	P40575	100 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	XPT1	P47165	209 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	SBH2	P52871	88 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	CAB5	Q03941	241 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	RIM9	Q04734	239 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	YDL242W	Q07746	117 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	TFC7	Q12415	435 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	SUA5	P32579	426 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	SSO2	P39926	295 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	GEP7	P53171	287 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	YNR064C	P53750	290 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	WSC2	P53832	503 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	GIM3	P53900	129 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	LIP2	Q06005	328 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	CSI2	Q08054	341 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	YOR292C	Q08743	309 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	CRC1	Q12289	327 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	SEC22	P22214	214 aa		3.15	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	VMA11	P32842	164 aa		3.15	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	RRF1	P38771	230 aa		3.15	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	PCL7	P40186	285 aa		3.15	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	GEP3	Q08622	556 aa		3.15	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	YDL009C	Q12210	107 aa		3.15	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	BBP1	Q12365	385 aa		3.15	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		3.15	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.15	□□□□□ -1.9
PPQ1	YPL179W	QCR2	P07257	368 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PPQ1	YPL179W	ATP10	P18496	279 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PPQ1	YPL179W	YCL042W	P25572	119 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PPQ1	YPL179W	ACB1	P31787	87 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PPQ1	YPL179W	YUH1	P35127	236 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PPQ1	YPL179W	CPR5	P35176	225 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PPQ1	YPL179W	GPI18	P38211	433 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PPQ1	YPL179W	VMA22	P38784	181 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PPQ1	YPL179W	GEP4	P38812	185 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PPQ1	YPL179W	RFC2	P40348	353 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PPQ1	YPL179W	PRM5	P40476	318 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PPQ1	YPL179W	YIR035C	P40579	254 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PPQ1	YPL179W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PPQ1	YPL179W	CRH1	P53301	507 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PPQ1	YPL179W	YNL234W	P53857	426 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PPQ1	YPL179W	VPS28	Q02767	242 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PPQ1	YPL179W	COA4	Q05809	96 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PPQ1	YPL179W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PPQ1	YPL179W	RRT7	Q07829	113 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PPQ1	YPL179W	GEP5	Q12393	293 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PPQ1	YPL179W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.9 ms