RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	LSB5	P25369	354 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	MRP20	P32387	263 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YUH1	P35127	236 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	ERV15	P38312	142 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	ECM14	P38836	430 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	PCL7	P40186	285 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YIR035C	P40579	254 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	JAC1	P53193	184 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YNL092W	P53934	400 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	TSA2	Q04120	196 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YFH1	Q07540	174 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	SOR2	Q07786	357 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	RKI1	Q12189	258 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YCT1	Q12235	531 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	ISN1	Q99312	450 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	DAL80	P26343	269 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	RMD6	P39975	231 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	SNX4	P47057	423 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	UBP8	P50102	471 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YNR064C	P53750	290 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	THI74	Q04083	370 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	LPP1	Q04396	274 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	FIT1	Q04433	528 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	GAT3	Q07928	141 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	IRC25	Q07951	179 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	FEX2	Q08991	375 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	RPL39	P04650	51 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	SPS100	P13130	326 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	PDC2	P32896	925 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	RPB7	P34087	171 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YOX1	P34161	385 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	SRY1	P36007	326 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	SSO2	P39926	295 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
TRM10	YOL093W	GON7	P46984	123 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YJR096W	P47137	282 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	TTI2	P47168	421 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	SRB7	P47822	140 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	SBH2	P52871	88 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	GEP7	P53171	287 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	GPI15	P53961	229 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	DID2	P69771	204 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	HSK3	P69852	69 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	CAC2	Q04199	468 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	RIM9	Q04734	239 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YPD1	Q07688	167 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	PAM18	Q07914	168 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	RFM1	Q12192	310 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	ATG31	Q12421	196 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YCR061W	P25639	631 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	SWD3	P38123	315 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	IKI1	P38874	309 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	POP2	P39008	433 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	VMA7	P39111	118 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	VPS28	Q02767	242 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	IZH3	Q07959	543 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	HRD1	Q08109	551 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	SWT1	Q12104	458 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	FRE8	Q12209	686 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	TFC7	Q12415	435 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	NUM1	Q00402	2748 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TRM10	YOL093W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TRM10	YOL093W	ATP10	P18496	279 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRM10	YOL093W	CPR5	P35176	225 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRM10	YOL093W	ECM31	P38122	312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRM10	YOL093W	GPI18	P38211	433 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRM10	YOL093W	SHG1	P38337	142 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRM10	YOL093W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TRM10	YOL093W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TRM10	YOL093W	PIR5	P46999	287 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRM10	YOL093W	YHC3	P47040	408 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRM10	YOL093W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TRM10	YOL093W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TRM10	YOL093W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TRM10	YOL093W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRM10	YOL093W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TRM10	YOL093W	ANT1	Q06497	328 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRM10	YOL093W	RRT7	Q07829	113 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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