RNA–Protein interactions for RNA: YOL085C

YOL085C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YOL085C, Length 342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOL085C	YOL085C	POP8	P38208	133 aa		12.7	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	TPN1	P53099	579 aa		12.7	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	YDL086W	Q07505	273 aa		12.7	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	HYM1	P32464	399 aa		12.69	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	MRPL13	Q02204	264 aa		12.69	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	COS8	P38723	381 aa		12.68	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	THI74	Q04083	370 aa		12.68	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	HRD1	Q08109	551 aa		12.68	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	VBA1	Q04301	562 aa		12.67	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	RTT103	Q05543	409 aa		12.67	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	YKR045C	P36138	183 aa		12.66	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	CAB5	Q03941	241 aa		12.66	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	PHO92	Q06390	306 aa		12.66	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	CAP2	P13517	287 aa		12.65	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	PHM8	P40025	321 aa		12.65	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	VPS55	P47111	140 aa		12.65	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	UBP8	P50102	471 aa		12.65	□□□□□ -0.38
YOL085C	YOL085C	LAG1	P38703	411 aa		12.64	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	AIM20	P40451	204 aa		12.64	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	RPA43	P46669	326 aa		12.64	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	NDE2	Q07500	545 aa		12.64	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	RDI1	Q12434	202 aa		12.64	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	VPS63	O13549	108 aa		12.63	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	YJL213W	P40896	331 aa		12.63	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	HOR7	Q05827	59 aa		12.63	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	LAS17	Q12446	633 aa		12.63	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	YOL029C	Q08187	201 aa		12.62	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	YKL075C	P36083	450 aa		12.61	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	IRC24	P40580	263 aa		12.61	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	CRH1	P53301	507 aa		12.61	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	YML122C	Q03207	126 aa		12.61	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	HBN1	Q96VH4	193 aa		12.61	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	MIG1	P27705	504 aa		12.6	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	YJL163C	P46996	555 aa		12.6	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	GEP4	P38812	185 aa		12.59	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		12.59	□□□□□ -0.39
YOL085C	YOL085C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	VPS71	Q03433	280 aa		12.58	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	QCR2	P07257	368 aa		12.57	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	SPS2	P08459	502 aa		12.57	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	FEX2	Q08991	375 aa		12.56	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	MRS4	P23500	304 aa		12.55	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	GPG1	P53130	126 aa		12.55	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	FSH2	Q05015	223 aa		12.55	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	PAM18	Q07914	168 aa		12.55	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	ATG5	Q12380	294 aa		12.55	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		12.55	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		12.54	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	MSN1	P22148	382 aa		12.54	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	MRPL3	P36516	390 aa		12.54	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	RFC2	P40348	353 aa		12.54	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	YKE4	P40544	346 aa		12.54	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	NIF3	P53081	288 aa		12.54	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	PEX10	Q05568	337 aa		12.54	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	ENV7	Q12003	364 aa		12.54	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	TRM13	Q12383	476 aa		12.54	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	STF2	P16965	84 aa		12.53	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	TOS8	P53147	276 aa		12.53	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	YNG1	Q08465	219 aa		12.53	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	ATG31	Q12421	196 aa		12.53	□□□□□ -0.4
YOL085C	YOL085C	RPD3	P32561	433 aa		12.52	□□□□□ -0.41
YOL085C	YOL085C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
YOL085C	YOL085C	RKI1	Q12189	258 aa		12.52	□□□□□ -0.41
YOL085C	YOL085C	ERV15	P38312	142 aa		12.51	□□□□□ -0.41
YOL085C	YOL085C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	12.51	□□□□□ -0.41	not detected
YOL085C	YOL085C	LST8	P41318	303 aa		12.51	□□□□□ -0.41
YOL085C	YOL085C	FEX1	Q08913	375 aa		12.51	□□□□□ -0.41
YOL085C	YOL085C	COX15	P40086	486 aa		12.5	□□□□□ -0.41
YOL085C	YOL085C	PRM3	Q08931	133 aa		12.5	□□□□□ -0.41
YOL085C	YOL085C	PRM4	Q12498	284 aa		12.5	□□□□□ -0.41
YOL085C	YOL085C	MRP17	P28778	131 aa		12.49	□□□□□ -0.41
YOL085C	YOL085C	YBR184W	P38299	523 aa		12.49	□□□□□ -0.41
YOL085C	YOL085C	YBR242W	P38331	238 aa		12.49	□□□□□ -0.41
YOL085C	YOL085C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
YOL085C	YOL085C	DFG10	P40526	253 aa		12.49	□□□□□ -0.41
YOL085C	YOL085C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
YOL085C	YOL085C	VPS28	Q02767	242 aa		12.49	□□□□□ -0.41
YOL085C	YOL085C	IRC23	Q08416	157 aa		12.49	□□□□□ -0.41
YOL085C	YOL085C	YCT1	Q12235	531 aa		12.49	□□□□□ -0.41
YOL085C	YOL085C	YPS1	P32329	569 aa		12.48	□□□□□ -0.41
YOL085C	YOL085C	YJR012C	P47087	207 aa		12.48	□□□□□ -0.41
YOL085C	YOL085C	COX18	P53239	316 aa		12.48	□□□□□ -0.41

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