RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	CAC2	Q04199	468 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	WSC3	Q12215	556 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	VMA3	P25515	160 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YPC1	P38298	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	RMD6	P39975	231 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	GMC1	Q04399	608 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	FCY22	Q12119	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YOR015W	Q12169	119 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	MSK1	P32048	576 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	GON7	P46984	123 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	FRE8	Q12209	686 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	SIP1	P32578	815 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	RPB7	P34087	171 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	EDS1	P38073	919 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	SWD3	P38123	315 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	HHO1	P53551	258 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	LIP2	Q06005	328 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	VAM3	Q12241	283 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	CKA1	P15790	372 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	ECM25	P32525	599 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YUH1	P35127	236 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YKL162C	P36052	402 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	RIB5	P38145	238 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	ECM14	P38836	430 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	POP2	P39008	433 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	XPT1	P47165	209 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	LDS1	P31379	325 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YKL187C	P34231	750 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YEA6	P39953	335 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YER121W	P40076	114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YIL024C	P40543	189 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	MOG1	P47123	218 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	MRPL22	P53881	309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	THI74	Q04083	370 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	RPL39	P04650	51 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	SPC29	P33419	253 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
AMD1	YML035C	IKI1	P38874	309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	FLO5	P38894	1075 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	SBH2	P52871	88 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	FIT1	Q04433	528 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	ECM18	Q04623	453 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	QCR2	P07257	368 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	GAT2	P40209	560 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	VMA21	P41806	77 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	ASM4	Q05166	528 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	TDA6	Q06466	467 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	ZEO1	Q08245	113 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	CPR5	P35176	225 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	SLM1	P40485	686 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
AMD1	YML035C	TAX4	P47030	604 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	BNA2	P47125	453 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	GEP7	P53171	287 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	SNA4	Q07549	140 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YOR292C	Q08743	309 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YCT1	Q12235	531 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	IRC24	P40580	263 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	GPI15	P53961	229 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YDR114C	Q04597	100 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YMR253C	Q04835	414 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YOL029C	Q08187	201 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YOL118C	Q08259	102 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	RAD28	Q12021	506 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	PAC2	P39937	518 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	PGD1	P40356	397 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	HSK3	P69852	69 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	TIM10	P87108	93 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	MEH1	Q02205	184 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	SPO24	Q3E752	67 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	COA2	Q3E823	68 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	ERG2	P32352	222 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64

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