RNA–Protein interactions for RNA: YLL013C

PUF3, Transcript of Protein of the mitochondrial outer surface, yeast

Gene PUF3, Length 2,640 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUF3	YLL013C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	SYM1	Q06563	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	HRD1	Q08109	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	LAG1	P38703	411 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	YJL213W	P40896	331 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	MSE1	P48525	536 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	VBA1	Q04301	562 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	HOR7	Q05827	59 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	YOR385W	Q08909	290 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	CPR4	P25334	318 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	MIG1	P27705	504 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	HYM1	P32464	399 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	RPA43	P46669	326 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	VPS55	P47111	140 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	UBP8	P50102	471 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	YOL029C	Q08187	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	BOL1	Q3E793	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	SPT14	P32363	452 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	FLO10	P36170	1169 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	RTT103	Q05543	409 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	RDI1	Q12434	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	CAP2	P13517	287 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	GEP4	P38812	185 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	TPN1	P53099	579 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	NRG1	Q03125	231 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	THI74	Q04083	370 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	IRC24	P40580	263 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	VPS63	O13549	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	YGL015C	P33199	130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	YNG1	Q08465	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	AIM20	P40451	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	YJL163C	P46996	555 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	MSN1	P22148	382 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	YKR045C	P36138	183 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	RFC2	P40348	353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	TOS8	P53147	276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	RPD3	P32561	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	CRH1	P53301	507 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	FSH2	Q05015	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	PHO92	Q06390	306 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	PAM18	Q07914	168 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	ATG31	Q12421	196 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
PUF3	YLL013C	GPG1	P53130	126 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	VPS71	Q03433	280 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	PRM3	Q08931	133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	TRM13	Q12383	476 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	LAS17	Q12446	633 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	SPS2	P08459	502 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	ELO2	P25358	347 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	COX18	P53239	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	FEX2	Q08991	375 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	QCR2	P07257	368 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	STF2	P16965	84 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	ERV15	P38312	142 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	COX15	P40086	486 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	YJR012C	P47087	207 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	YML122C	Q03207	126 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	ATG5	Q12380	294 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	MRS4	P23500	304 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	YBR144C	P34215	104 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	MRPL3	P36516	390 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	YBR184W	P38299	523 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	RKI1	Q12189	258 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	PRM4	Q12498	284 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUF3	YLL013C	SUA5	P32579	426 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUF3	YLL013C	LST8	P41318	303 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUF3	YLL013C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PUF3	YLL013C	ERG25	P53045	309 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUF3	YLL013C	NIF3	P53081	288 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUF3	YLL013C	CAB4	P53332	305 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUF3	YLL013C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PUF3	YLL013C	PEX10	Q05568	337 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUF3	YLL013C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PUF3	YLL013C	MRP17	P28778	131 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUF3	YLL013C	YPS1	P32329	569 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUF3	YLL013C	YMR181C	Q03231	154 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUF3	YLL013C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUF3	YLL013C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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