RNA–Protein interactions for RNA: YGR169C

PUS6, Transcript of tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS6, Length 1,215 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS6	YGR169C	PIR5	P46999	287 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	TTI2	P47168	421 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	YGL114W	P53134	725 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	HSK3	P69852	69 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	YML018C	Q03730	393 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	CKA1	P15790	372 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	YHR122W	P38829	231 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	BNA1	P47096	177 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	FIT1	Q04433	528 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	PEX10	Q05568	337 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	ORM2	Q06144	216 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	SOR2	Q07786	357 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	YOR385W	Q08909	290 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	BBP1	Q12365	385 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	UBA3	Q99344	299 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	SPS2	P08459	502 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	CPR4	P25334	318 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	ATG22	P25568	528 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	RPB7	P34087	171 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	FIG1	P38224	298 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	LAG1	P38703	411 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	YER188W	P40103	239 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	DIE2	P50076	525 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	MEH1	Q02205	184 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	RIM9	Q04734	239 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	YDR286C	Q05530	114 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	PHO92	Q06390	306 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	SCP1	Q08873	200 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	YOR029W	Q12243	111 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	MED4	Q12343	284 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	DGK1	Q12382	290 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	RDI1	Q12434	202 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	PET20	Q99373	253 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PUS6	YGR169C	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	CCW14	O13547	238 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	FMT1	P32785	401 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	MRPL3	P36516	390 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	POP2	P39008	433 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	WSC2	P53832	503 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	SYM1	Q06563	197 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	SEN2	P16658	377 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	LSB5	P25369	354 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	LAC1	P28496	418 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	AGA2	P32781	87 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	YBR242W	P38331	238 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	PHO85	P17157	305 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	MRP20	P32387	263 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	SRY1	P36007	326 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	ECM31	P38122	312 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	IKI1	P38874	309 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	SSO2	P39926	295 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	YKE4	P40544	346 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	YGL262W	P53054	175 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	VBA1	Q04301	562 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	LPP1	Q04396	274 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	RTT103	Q05543	409 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	YFH1	Q07540	174 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	YPD1	Q07688	167 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	YOL029C	Q08187	201 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	YOL118C	Q08259	102 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	YOR292C	Q08743	309 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	SWT1	Q12104	458 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	TFC7	Q12415	435 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PUS6	YGR169C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76

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