RNA–Protein interactions for RNA: YHR204W

MNL1, Transcript of Alpha-1,2-specific exomannosidase of the endoplasmic reticulum, yeast

Gene MNL1, Length 2,391 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MNL1	YHR204W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MNL1	YHR204W	LTV1	P34078	463 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MNL1	YHR204W	SLX8	P40072	274 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MNL1	YHR204W	ARH1	P48360	493 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MNL1	YHR204W	TUB4	P53378	473 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MNL1	YHR204W	HAP5	Q02516	242 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MNL1	YHR204W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MNL1	YHR204W	HIR3	P47171	1648 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MNL1	YHR204W	PEP12	P32854	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MNL1	YHR204W	CIN4	P39110	191 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MNL1	YHR204W	CDC45	Q08032	650 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MNL1	YHR204W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	FKH1	P40466	484 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	YGL081W	P53156	320 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	SAP30	P38429	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	VPS60	Q03390	229 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	LCD1	Q04377	747 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	KOG1	P38873	1557 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	ISF1	P32488	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	PLP2	Q12017	286 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	YDL206W	Q12424	762 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	TGL4	P36165	910 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	BDP1	P46678	594 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	MCM16	Q12262	181 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	SSK2	P53599	1579 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	IRC20	Q06554	1556 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	RAD51	P25454	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	PUP2	P32379	260 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	COG8	Q04632	607 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	RKM3	P38222	552 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	BNI4	P53858	892 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	ARP5	P53946	755 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	ESC2	Q06340	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	YDL144C	Q07589	356 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	SFI1	Q12369	946 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	GCN2	P15442	1659 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	NPL4	P33755	580 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	SWH1	P35845	1188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	HOT1	Q03213	719 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	FIG4	P42837	879 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	EMP47	P43555	445 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	RPA14	P50106	137 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	ITC1	P53125	1264 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	SML1	Q04964	104 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	MNR2	P35724	969 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	TCD1	P38756	429 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	RNT1	Q02555	471 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	SLP1	Q12232	587 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	NUP159	P40477	1460 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	APL6	P46682	809 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MNL1	YHR204W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MNL1	YHR204W	TBF1	Q02457	562 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MNL1	YHR204W	VPS72	Q03388	795 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MNL1	YHR204W	VPS15	P22219	1454 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MNL1	YHR204W	ESP1	Q03018	1630 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MNL1	YHR204W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MNL1	YHR204W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MNL1	YHR204W	SWR1	Q05471	1514 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MNL1	YHR204W	DAL5	P15365	543 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MNL1	YHR204W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
MNL1	YHR204W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MNL1	YHR204W	FRA1	Q07825	749 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MNL1	YHR204W	TLG2	Q08144	397 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MNL1	YHR204W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MNL1	YHR204W	MIC60	P36112	540 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MNL1	YHR204W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MNL1	YHR204W	YGL082W	P53155	381 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MNL1	YHR204W	SSL2	Q00578	843 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MNL1	YHR204W	ECM23	Q02710	187 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MNL1	YHR204W	TIM50	Q02776	476 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MNL1	YHR204W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69

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