RNA–Protein interactions for RNA: YHR087W

RTC3, Transcript of Protein of unknown function involved in RNA metabolism, yeast

Gene RTC3, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTC3	YHR087W	SSP2	Q08646	371 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RTC3	YHR087W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
RTC3	YHR087W	YGR122W	P53272	402 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RTC3	YHR087W	CWH41	P53008	833 aa		18.36	■□□□□ 0.53
RTC3	YHR087W	MDG1	P53885	366 aa		18.36	■□□□□ 0.53
RTC3	YHR087W	ZDS2	P54786	942 aa		18.36	■□□□□ 0.53
RTC3	YHR087W	SWI1	P09547	1314 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RTC3	YHR087W	PUS5	Q06244	254 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RTC3	YHR087W	NUP133	P36161	1157 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RTC3	YHR087W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
RTC3	YHR087W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
RTC3	YHR087W	PHM7	Q12252	991 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RTC3	YHR087W	SWC3	P31376	625 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RTC3	YHR087W	OPY1	P38271	328 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RTC3	YHR087W	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
RTC3	YHR087W	NKP2	Q06162	153 aa		18.28	■□□□□ 0.52
RTC3	YHR087W	RAD50	P12753	1312 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RTC3	YHR087W	YLR271W	Q06152	274 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RTC3	YHR087W	YPR204W	Q08995	1032 aa		18.27	■□□□□ 0.52
RTC3	YHR087W	CDC16	P09798	840 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RTC3	YHR087W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
RTC3	YHR087W	UBP12	P39538	1254 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RTC3	YHR087W	FPK1	P53739	893 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RTC3	YHR087W	VPS64	Q03944	604 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RTC3	YHR087W	TOM1	Q03280	3268 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RTC3	YHR087W	NYV1	Q12255	253 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RTC3	YHR087W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
RTC3	YHR087W	ARG8	P18544	423 aa		18.21	■□□□□ 0.51
RTC3	YHR087W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
RTC3	YHR087W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
RTC3	YHR087W	IME2	P32581	645 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RTC3	YHR087W	PFF1	P38244	976 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RTC3	YHR087W	CTI6	Q08923	506 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RTC3	YHR087W	MTC5	Q03897	1148 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RTC3	YHR087W	NCB2	Q92317	146 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RTC3	YHR087W	TEA1	P47988	759 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RTC3	YHR087W	GCR2	Q01722	534 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RTC3	YHR087W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
RTC3	YHR087W	DCD1	P06773	312 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RTC3	YHR087W	ITC1	P53125	1264 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RTC3	YHR087W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	18.12	■□□□□ 0.49
RTC3	YHR087W	BDP1	P46678	594 aa		18.12	■□□□□ 0.49
RTC3	YHR087W	PKH1	Q03407	766 aa		18.12	■□□□□ 0.49
RTC3	YHR087W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	18.1	■□□□□ 0.49
RTC3	YHR087W	SLI15	P38283	698 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RTC3	YHR087W	PSH1	Q12161	406 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RTC3	YHR087W	DLD1	P32891	587 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RTC3	YHR087W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	18.08	■□□□□ 0.48
RTC3	YHR087W	PCT1	P13259	424 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RTC3	YHR087W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	18.07	■□□□□ 0.48
RTC3	YHR087W	YGL082W	P53155	381 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RTC3	YHR087W	TOP1	P04786	769 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RTC3	YHR087W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	18.06	■□□□□ 0.48
RTC3	YHR087W	BRN1	P38170	754 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RTC3	YHR087W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	18.05	■□□□□ 0.48
RTC3	YHR087W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	18.05	■□□□□ 0.48
RTC3	YHR087W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	18.05	■□□□□ 0.48
RTC3	YHR087W	SAC3	P46674	1301 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RTC3	YHR087W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
RTC3	YHR087W	YGL242C	P53066	181 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RTC3	YHR087W	MLC1	P53141	149 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RTC3	YHR087W	ERO1	Q03103	563 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RTC3	YHR087W	ATG20	Q07528	640 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RTC3	YHR087W	PDR18	P53756	1333 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RTC3	YHR087W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	18.02	■□□□□ 0.48
RTC3	YHR087W	FCP1	Q03254	732 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RTC3	YHR087W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	18.01	■□□□□ 0.47
RTC3	YHR087W	SHC1	P39000	512 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RTC3	YHR087W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
RTC3	YHR087W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
RTC3	YHR087W	HXT10	P43581	546 aa		18	■□□□□ 0.47
RTC3	YHR087W	HAT1	Q12341	374 aa		18	■□□□□ 0.47
RTC3	YHR087W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	17.99	■□□□□ 0.47
RTC3	YHR087W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	17.98	■□□□□ 0.47
RTC3	YHR087W	GYP5	Q12344	894 aa		17.98	■□□□□ 0.47
RTC3	YHR087W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	17.97	■□□□□ 0.47
RTC3	YHR087W	IRC3	Q06683	689 aa		17.97	■□□□□ 0.47
RTC3	YHR087W	YLR278C	Q05854	1341 aa		17.97	■□□□□ 0.47
RTC3	YHR087W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	17.96	■□□□□ 0.47
RTC3	YHR087W	HXT13	P39924	564 aa		17.96	■□□□□ 0.47
RTC3	YHR087W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	17.96	■□□□□ 0.47
RTC3	YHR087W	BDF2	Q07442	638 aa		17.96	■□□□□ 0.47
RTC3	YHR087W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	17.96	■□□□□ 0.47
RTC3	YHR087W	RLF2	Q12495	606 aa		17.95	■□□□□ 0.46
RTC3	YHR087W	YKU70	P32807	602 aa		17.94	■□□□□ 0.46
RTC3	YHR087W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	17.94	■□□□□ 0.46
RTC3	YHR087W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	17.94	■□□□□ 0.46
RTC3	YHR087W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	17.93	■□□□□ 0.46
RTC3	YHR087W	MRPS35	P53292	345 aa		17.93	■□□□□ 0.46
RTC3	YHR087W	HXT17	P53631	564 aa		17.93	■□□□□ 0.46
RTC3	YHR087W	PMD1	P32634	1753 aa		17.92	■□□□□ 0.46
RTC3	YHR087W	SIT4	P20604	311 aa		17.92	■□□□□ 0.46
RTC3	YHR087W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	17.92	■□□□□ 0.46
RTC3	YHR087W	RIM20	Q12033	661 aa		17.92	■□□□□ 0.46
RTC3	YHR087W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	17.91	■□□□□ 0.46
RTC3	YHR087W	SRS2	P12954	1174 aa		17.9	■□□□□ 0.46
RTC3	YHR087W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	17.9	■□□□□ 0.46
RTC3	YHR087W	ADR1	P07248	1323 aa		17.9	■□□□□ 0.46
RTC3	YHR087W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	17.89	■□□□□ 0.45
RTC3	YHR087W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	17.89	■□□□□ 0.45

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