RNA–Protein interactions for RNA: YDL057W

YDL057W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YDL057W, Length 987 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL057WYDL057W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
YDL057WYDL057W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
YDL057WYDL057W YKL222CP35995 705 aa7.42□□□□□ -1.22
YDL057WYDL057W VRP1P37370 817 aa7.42□□□□□ -1.22
YDL057WYDL057W SQS1P53866 767 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
YDL057WYDL057W SPE2P21182 396 aa7.41□□□□□ -1.22
YDL057WYDL057W RRT14P40470 206 aa7.4□□□□□ -1.22
YDL057WYDL057W HPC2Q01448 625 aa7.4□□□□□ -1.22
YDL057WYDL057W PEX29Q03370 554 aa7.4□□□□□ -1.22
YDL057WYDL057W SIR4P11978 1358 aa7.4□□□□□ -1.22
YDL057WYDL057W ERT1P38140 529 aa7.39□□□□□ -1.23
YDL057WYDL057W FPK1P53739 893 aa7.39□□□□□ -1.23
YDL057WYDL057W RPO41P13433 1351 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
YDL057WYDL057W ADE16P54113 591 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
YDL057WYDL057W KIN4Q01919 800 aa7.38□□□□□ -1.23
YDL057WYDL057W YLL066CQ99208 1374 aa7.37□□□□□ -1.23
YDL057WYDL057W ATG13Q06628 738 aa7.37□□□□□ -1.23
YDL057WYDL057W GRX1P25373 110 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
YDL057WYDL057W DUS1P53759 423 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
YDL057WYDL057W CWH41P53008 833 aa7.35□□□□□ -1.23
YDL057WYDL057W MPC54Q08550 464 aa7.35□□□□□ -1.23
YDL057WYDL057W RPS9BP05755 195 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
YDL057WYDL057W SLI15P38283 698 aa7.34□□□□□ -1.23
YDL057WYDL057W SET1P38827 1080 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
YDL057WYDL057W XDJ1P39102 459 aa7.34□□□□□ -1.23
YDL057WYDL057W SPT23P35210 1082 aa7.33□□□□□ -1.24
YDL057WYDL057W HAP5Q02516 242 aa7.33□□□□□ -1.24
YDL057WYDL057W NYV1Q12255 253 aa7.33□□□□□ -1.24
YDL057WYDL057W POM152P39685 1337 aa7.31□□□□□ -1.24
YDL057WYDL057W DPS1P04802 557 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
YDL057WYDL057W KEX1P09620 729 aa7.3□□□□□ -1.24
YDL057WYDL057W RIX7Q07844 837 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
YDL057WYDL057W RPP0P05317 312 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
YDL057WYDL057W ETP1P38748 585 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
YDL057WYDL057W CDC45Q08032 650 aa7.29□□□□□ -1.24
YDL057WYDL057W OSM1P21375 501 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YDL057WYDL057W RET1P22276 1149 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YDL057WYDL057W VPS27P40343 622 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YDL057WYDL057W BNI4P53858 892 aa7.28□□□□□ -1.24
YDL057WYDL057W NMA111P53920 997 aa7.28□□□□□ -1.24
YDL057WYDL057W PFF1P38244 976 aa7.27□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W RTF1P53064 558 aa7.27□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W GAS4Q08271 471 aa7.27□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W YML133CQ03099 1374 aa7.26□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W YLL067CQ07888 1374 aa7.26□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W FUN12P39730 1002 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W DPL1Q05567 589 aa7.26□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W FAS2P19097 1887 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W PDI1P17967 522 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W SDH2P21801 266 aa7.25□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W FPR3P38911 411 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W VHR2P40041 505 aa7.25□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W ATG20Q07528 640 aa7.25□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W INP54Q08227 384 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W UTP10P42945 1769 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W THS1P04801 734 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W RTG2P32608 588 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W UBP14P38237 781 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W PTC2P39966 464 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W YBP2P53169 641 aa7.24□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W YDL144CQ07589 356 aa7.24□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W RVB2Q12464 471 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W SHC1P39000 512 aa7.23□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W CDC73Q06697 393 aa7.23□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W YLR278CQ05854 1341 aa7.23□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W MAC1P35192 417 aa7.22□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W IOC4Q04213 475 aa7.22□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YDL057WYDL057W TOP1P04786 769 aa7.21□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W TRK1P12685 1235 aa7.21□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W SMY1P32364 656 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W GRX4P32642 244 aa7.21□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W CTI6Q08923 506 aa7.21□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W YRB30P53107 440 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W ERO1Q03103 563 aa7.2□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W SRF1Q12516 437 aa7.2□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W YPR015CQ12531 247 aa7.2□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data7.19□□□□□ -1.26not detected
YDL057WYDL057W RPC31P17890 251 aa7.18□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W ICL1P28240 557 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W YKU70P32807 602 aa7.18□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W MPP10P47083 593 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W LPD1P09624 499 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W SUI2P20459 304 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W CTF4Q01454 927 aa7.17□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W TAP42Q04372 366 aa7.17□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W PMD1P32634 1753 aa7.17□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W RAM1P22007 431 aa7.16□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W RTR1P40084 226 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W YIL089WP40500 205 aa7.16□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W MDG1P53885 366 aa7.16□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W ISU2Q12056 156 aa7.16□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W FIG2P25653 1609 aa7.16□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W KAR2P16474 682 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W RAD54P32863 898 aa7.15□□□□□ -1.26
YDL057WYDL057W TEA1P47988 759 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.6 ms