RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEUROD2	Q15784	382 aa		9.96	□□□□□ -0.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		9.96	□□□□□ -0.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	PBRM1	Q86U86	1689 aa		9.96	□□□□□ -0.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDE4D	Q08499	809 aa		9.95	□□□□□ -0.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	AMHR2	Q16671	573 aa		9.95	□□□□□ -0.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYNJ2	O15056	1496 aa		9.94	□□□□□ -0.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		9.94	□□□□□ -0.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	GRIN2A	Q12879	1464 aa		9.93	□□□□□ -0.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	9.93	□□□□□ -0.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	CUL7	Q14999	1698 aa		9.93	□□□□□ -0.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		9.91	□□□□□ -0.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	ST18	O60284	1047 aa		9.91	□□□□□ -0.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	COL9A1	P20849	921 aa		9.91	□□□□□ -0.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	PADI6	Q6TGC4	694 aa		9.91	□□□□□ -0.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	9.91	□□□□□ -0.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUP160	Q12769	1436 aa		9.9	□□□□□ -0.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRSS12	P56730	875 aa		9.9	□□□□□ -0.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	9.9	□□□□□ -0.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	CEP170	Q5SW79	1584 aa		9.89	□□□□□ -0.83
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTPRE	P23469	700 aa		9.89	□□□□□ -0.83
RABGGTB-212	ENST00000491266	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	9.89	□□□□□ -0.83
RABGGTB-212	ENST00000491266	CEP162	Q5TB80	1403 aa		9.89	□□□□□ -0.83
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		9.88	□□□□□ -0.83
RABGGTB-212	ENST00000491266	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		9.88	□□□□□ -0.83
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		9.88	□□□□□ -0.83
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		9.88	□□□□□ -0.83
RABGGTB-212	ENST00000491266	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	9.87	□□□□□ -0.83
RABGGTB-212	ENST00000491266	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		9.87	□□□□□ -0.83
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		9.87	□□□□□ -0.83
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHOX2B	Q99453	314 aa		9.86	□□□□□ -0.83
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		9.86	□□□□□ -0.83
RABGGTB-212	ENST00000491266	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		9.85	□□□□□ -0.83
RABGGTB-212	ENST00000491266	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	9.85	□□□□□ -0.83
RABGGTB-212	ENST00000491266	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		9.85	□□□□□ -0.83
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		9.85	□□□□□ -0.83
RABGGTB-212	ENST00000491266	OAT	P04181	439 aa		9.84	□□□□□ -0.83
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSKS	Q9UJT2	592 aa		9.84	□□□□□ -0.83
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERBB3	P21860	1342 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLIP1	P30622	1438 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	9.83	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARAP1	Q96P48	1450 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHD1	O14646	1710 aa		9.82	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		9.82	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM161A	Q3B820	660 aa		9.82	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	EMP3	P54852	163 aa		9.81	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNK17	Q96T54	332 aa		9.81	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		9.81	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	DISP1	Q96F81	1524 aa		9.81	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	C3orf80	F5H4A9	247 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	EYA1	Q99502	592 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARHGAP33	O14559	1287 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLCN1	P35523	988 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	PBX2	P40425	430 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	MARVELD3	Q96A59	401 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	IQGAP2	Q13576	1575 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		9.79	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	POTEB3	A0JP26	581 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSEN2	P49810	448 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	PROX2	Q3B8N5	592 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	POTEB	Q6S5H4	581 aa		9.78	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	9.78	□□□□□ -0.84
RABGGTB-212	ENST00000491266	MS4A1	P11836	297 aa		9.77	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	9.77	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNH8	Q96L42	1107 aa		9.77	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM117A	Q9C073	453 aa		9.77	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	SAMD9	Q5K651	1589 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM205C	A6NFA0	338 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	TATDN2	Q93075	761 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	9.75	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	9.75	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	NBPF26	B4DH59	902 aa		9.75	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		9.75	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		9.75	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		9.74	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	PACS2	Q86VP3	889 aa		9.74	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL27	Q8NEV9	243 aa		9.74	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	9.74	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	SHROOM2	Q13796	1616 aa		9.74	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	RCCD1	A6NED2	376 aa		9.73	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	NLRP7	Q8WX94	980 aa		9.73	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	PNMA3	Q9UL41	463 aa		9.73	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		9.72	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		9.72	□□□□□ -0.85
RABGGTB-212	ENST00000491266	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		9.72	□□□□□ -0.85

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