RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001711.5

Hoxc6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

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Gene Hoxc6, Length 1,581 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rgl3Q3UYI5 709 aa26.9■■□□□ 1.9
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Txndc2Q6P902 515 aa26.85■■□□□ 1.89
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dip2aQ8BWT5 1523 aa26.84■■□□□ 1.89
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa26.84■■□□□ 1.89
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Scn4aQ9ER60 1841 aa26.81■■□□□ 1.88
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 TonslQ6NZL6 1363 aa26.81■■□□□ 1.88
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tulp4Q9JIL5 1547 aa26.8■■□□□ 1.88
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 P3h3Q8CG70 732 aa26.8■■□□□ 1.88
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 PplQ9R269 1755 aa26.8■■□□□ 1.88
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Adamts13Q769J6 1426 aa26.78■■□□□ 1.88
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Psme1P97371 249 aa26.76■■□□□ 1.87
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 AU022751B1B0V2 589 aa26.75■■□□□ 1.87
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rims2Q9EQZ7 1530 aa26.74■■□□□ 1.87
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rims1Q99NE5 1463 aa26.74■■□□□ 1.87
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm13695A2AK44 830 aa26.73■■□□□ 1.87
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa26.73■■□□□ 1.87
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Neurod1Q60867 357 aa26.71■■□□□ 1.87
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa26.7■■□□□ 1.87
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ncoa1P70365 1447 aa26.7■■□□□ 1.86
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Myo3aQ8K3H5 1613 aa26.7■■□□□ 1.86
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa26.68■■□□□ 1.86
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Atp1b4Q99ME6 356 aa26.68■■□□□ 1.86
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 PalldQ9ET54 1408 aa26.67■■□□□ 1.86
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Arhgef28P97433 1693 aa26.66■■□□□ 1.86
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Polr3aB2RXC6 1390 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kdm2aP59997 1161 aa26.63■■□□□ 1.85
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pip4k2bQ80XI4 416 aa26.63■■□□□ 1.85
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Shq1Q7TMX5 569 aa26.61■■□□□ 1.85
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc52a2Q9D8F3 450 aa26.61■■□□□ 1.85
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Setd1aE9PYH6 1716 aa26.61■■□□□ 1.85
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mbd5B1AYB6 1498 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Os9Q8K2C7 672 aa26.59■■□□□ 1.85
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slit3Q9WVB4 1523 aa26.59■■□□□ 1.85
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Q9D9H8 365 aa26.58■■□□□ 1.85
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 IghaA0A0A6YXW6 389 aa26.58■■□□□ 1.85
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mug2P28666 1451 aa26.56■■□□□ 1.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Asxl2Q8BZ32 1370 aa26.56■■□□□ 1.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa26.55■■□□□ 1.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 PzpQ61838 1495 aa26.55■■□□□ 1.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm20521D3Z5F7 333 aa26.54■■□□□ 1.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Med1Q925J9 1575 aa26.54■■□□□ 1.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fan1Q69ZT1 1020 aa26.54■■□□□ 1.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa26.53■■□□□ 1.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 MaddQ80U28 1577 aa26.52■■□□□ 1.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rapgef3Q8VCC8 918 aa26.51■■□□□ 1.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pik3r4Q8VD65 1358 aa26.48■■□□□ 1.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dapk1Q80YE7 1442 aa26.46■■□□□ 1.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa26.45■■□□□ 1.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lrrc7Q80TE7 1490 aa26.44■■□□□ 1.82
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Arap3Q8R5G7 1538 aa26.42■■□□□ 1.82
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa26.42■■□□□ 1.82
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa26.41■■□□□ 1.82
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rundc1Q0VDN7 615 aa26.41■■□□□ 1.82
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa26.41■■□□□ 1.82
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa26.4■■□□□ 1.82
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa26.39■■□□□ 1.82
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Stk26Q99JT2 416 aa26.38■■□□□ 1.81
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Card11Q8CIS0 1159 aa26.37■■□□□ 1.81
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Usp40Q8BWR4 1235 aa26.36■■□□□ 1.81
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 IqubQ8CDK3 788 aa26.34■■□□□ 1.81
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cps1Q8C196 1500 aa26.34■■□□□ 1.81
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 DnmbpQ6TXD4 1580 aa26.34■■□□□ 1.81
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Stard8Q8K031 1019 aa26.33■■□□□ 1.81
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gli3Q61602 1583 aa26.33■■□□□ 1.81
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nphp4P59240 1425 aa26.33■■□□□ 1.81
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Plekhg1F6S200 1446 aa26.31■■□□□ 1.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ift172Q6VH22 1749 aa26.3■■□□□ 1.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tns3Q5SSZ5 1440 aa26.29■■□□□ 1.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cep170bQ80U49 1574 aa26.29■■□□□ 1.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Stag3O70576 1240 aa26.29■■□□□ 1.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa26.29■■□□□ 1.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Srcin1Q9QWI6 1250 aa26.28■■□□□ 1.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rock2P70336 1388 aa26.22■■□□□ 1.79
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa26.22■■□□□ 1.79
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa26.21■■□□□ 1.79
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zbtb4Q5F293 982 aa26.2■■□□□ 1.78
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Col18a1P39061 1774 aa26.2■■□□□ 1.78
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tmem94Q7TSH8 1360 aa26.16■■□□□ 1.78
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Abca14E9Q8F8 1683 aa26.16■■□□□ 1.78
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