RNA–Protein interactions for RNA: YML034W

SRC1, Transcript of Inner nuclear membrane protein, yeast

Gene SRC1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRC1	YML034W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	BSC6	Q08280	497 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	MMT2	Q08970	484 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	YCT1	Q12235	531 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	YDR262W	Q12331	272 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	APE1	P14904	514 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	GLN3	P18494	730 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	GPI12	P23797	304 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	TRS65	P32893	560 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	CLB6	P32943	380 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	MRPS9	P38120	278 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	CHL4	P38907	458 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	YAL037W	P39728	267 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	MIC26	P50087	233 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	ERG25	P53045	309 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	INP1	Q03694	420 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	FIT1	Q04433	528 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	YML096W	Q04489	525 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	YMR252C	Q04814	134 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	DIC1	Q06143	298 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	RRT7	Q07829	113 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	2.67	□□□□□ -1.98	not detected
SRC1	YML034W	COA6	Q3E846	104 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	YEF1	P32622	495 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	YSC83	P32792	385 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	SHE1	P38200	338 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	CUE1	P38428	203 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	FIS1	P40515	155 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	RRT5	P43607	289 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	DUG3	P53871	357 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	ATC1	Q04005	294 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	HAP2	P06774	265 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	PHO2	P07269	559 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	FIG1	P38224	298 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	YIL067C	P40514	678 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	POP1	P41812	875 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	IBD2	P53892	351 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	MET31	Q03081	177 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	ADD37	Q03233	198 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	CNL1	Q06333	122 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	YLR413W	Q06689	675 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	YLR030W	Q07967	263 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	ERV2	Q12284	196 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	PST1	Q12355	444 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	IZH4	Q99393	312 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	HEM2	P05373	342 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	CBS1	P14066	229 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	LDB7	P38210	180 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.66	□□□□□ -1.98	not detected
SRC1	YML034W	YJL132W	P47014	750 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	YNL260C	P53846	198 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	DAD3	P69850	94 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	CDC14	Q00684	551 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	GOT1	Q03554	138 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	AVO2	Q04749	426 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	SEI1	Q06058	285 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	LDS2	Q08218	356 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	PRR2	Q12310	699 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	SKS1	Q12505	502 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	SFG1	Q12507	346 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	YOS1	Q3E834	85 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SRC1	YML034W	MSF1	P08425	469 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	EPT1	P22140	391 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	POP5	P28005	173 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	ERG3	P32353	365 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	MNS1	P32906	549 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	YUH1	P35127	236 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	GPI16	P38875	610 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	YEL028W	P39989	153 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	BNS1	P50084	137 aa		2.65	□□□□□ -1.99

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