RNA–Protein interactions for RNA: YJR086W

STE18, Transcript of G protein gamma subunit, yeast

Gene STE18, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STE18	YJR086W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	MRPL50	P53724	139 aa		0.58	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	SWP1	Q02795	286 aa		0.58	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	YOL107W	Q12239	342 aa		0.58	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		0.57	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	MRPL17	P36528	281 aa		0.57	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	OPY1	P38271	328 aa		0.57	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	YJR149W	P47177	404 aa		0.56	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	GPM2	Q12008	311 aa		0.56	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	ATG40	Q99325	256 aa		0.56	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	SKG1	P36169	355 aa		0.55	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	CUE1	P38428	203 aa		0.55	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	FLX1	P40464	311 aa		0.55	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	0.55	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	TRM9	P49957	279 aa		0.55	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		0.55	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	TIM9	O74700	87 aa		0.54	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	KRE28	Q04431	385 aa		0.54	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	PAM18	Q07914	168 aa		0.54	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	DRS2	P39524	1355 aa		0.54	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		0.53	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	SIR2	P06700	562 aa		0.53	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	YFL065C	P43539	102 aa		0.53	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	BNA6	P43619	295 aa		0.53	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	CWC27	Q02770	301 aa		0.53	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	0.53	□□□□□ -2.32
STE18	YJR086W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.52	□□□□□ -2.33	not detected
STE18	YJR086W	PRM8	P53174	237 aa		0.52	□□□□□ -2.33
STE18	YJR086W	RAD28	Q12021	506 aa		0.52	□□□□□ -2.33
STE18	YJR086W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		0.52	□□□□□ -2.33
STE18	YJR086W	SEC11	P15367	167 aa		0.51	□□□□□ -2.33
STE18	YJR086W	MRPL25	P23369	157 aa		0.51	□□□□□ -2.33
STE18	YJR086W	YBR285W	P38354	144 aa		0.51	□□□□□ -2.33
STE18	YJR086W	YHL042W	P38729	150 aa		0.51	□□□□□ -2.33
STE18	YJR086W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
STE18	YJR086W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
STE18	YJR086W	DBF2	P22204	572 aa		0.49	□□□□□ -2.33
STE18	YJR086W	STP22	P25604	385 aa		0.49	□□□□□ -2.33
STE18	YJR086W	NUP84	P52891	726 aa		0.49	□□□□□ -2.33
STE18	YJR086W	MCP1	Q12106	302 aa		0.48	□□□□□ -2.33
STE18	YJR086W	ATG31	Q12421	196 aa		0.48	□□□□□ -2.33
STE18	YJR086W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
STE18	YJR086W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
STE18	YJR086W	SPT3	P06844	337 aa		0.46	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	URA6	P15700	204 aa		0.46	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	CDC123	Q05791	360 aa		0.46	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	RIB7	P33312	244 aa		0.45	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	VMA22	P38784	181 aa		0.45	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	FYV6	P53913	173 aa		0.45	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	YLR173W	Q06247	608 aa		0.45	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	LCL2	Q08045	131 aa		0.45	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	SEC17	P32602	292 aa		0.44	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	LDB7	P38210	180 aa		0.44	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	YDR274C	P87283	123 aa		0.44	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	YIL177C	P40434	1758 aa		0.44	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	YJL225C	P40889	1758 aa		0.44	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	MDM35	O60200	86 aa		0.43	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	BET1	P22804	142 aa		0.43	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	YUH1	P35127	236 aa		0.43	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	YOL160W	Q08321	113 aa		0.43	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	MED4	Q12343	284 aa		0.43	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	ECM4	P36156	370 aa		0.42	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	YPL073C	P40323	161 aa		0.42	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	YFH7	P43591	353 aa		0.42	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	FAR7	P43592	221 aa		0.42	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	KSS1	P14681	368 aa		0.41	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	RPO26	P20435	155 aa		0.41	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	SSO1	P32867	290 aa		0.41	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	APS1	P35181	156 aa		0.41	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	RMD6	P39975	231 aa		0.41	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	BXI1	P48558	297 aa		0.41	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	RRT8	Q08219	342 aa		0.41	□□□□□ -2.34
STE18	YJR086W	YCL042W	P25572	119 aa		0.4	□□□□□ -2.35
STE18	YJR086W	TVP23	P38962	199 aa		0.4	□□□□□ -2.35
STE18	YJR086W	SRL4	Q03085	281 aa		0.4	□□□□□ -2.35
STE18	YJR086W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
STE18	YJR086W	PTM1	P32857	523 aa		0.39	□□□□□ -2.35
STE18	YJR086W	COX15	P40086	486 aa		0.39	□□□□□ -2.35
STE18	YJR086W	FMC1	P40491	155 aa		0.39	□□□□□ -2.35
STE18	YJR086W	BRR6	P53062	197 aa		0.39	□□□□□ -2.35
STE18	YJR086W	YDR249C	Q03787	373 aa		0.39	□□□□□ -2.35
STE18	YJR086W	YMR252C	Q04814	134 aa		0.39	□□□□□ -2.35
STE18	YJR086W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
STE18	YJR086W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.38	□□□□□ -2.35	not detected

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 62.1 ms