RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A SAY1P53324 424 aa1.01□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A FYV6P53913 173 aa1.01□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A CDC123Q05791 360 aa1.01□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A PDR18P53756 1333 aa1□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A MATALPHA1P0CY06 175 aa1□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A HMLALPHA1P0CY07 175 aa1□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A TFC1P32367 649 aa1□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A SRY1P36007 326 aa1□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A TCD1P38756 429 aa1□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A BRR6P53062 197 aa1□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data1□□□□□ -2.25not detected
RPC10YHR143W-A QCR8P08525 94 aa0.99□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A TCA17P32613 152 aa0.99□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A APS1P35181 156 aa0.99□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A TVP38P36164 337 aa0.99□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A SKG1P36169 355 aa0.99□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A MRPL17P36528 281 aa0.99□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A FAR7P43592 221 aa0.99□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A MPA43P53583 542 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A YNR077CP53758 84 aa0.99□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A CUS2P53830 285 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A FSF1Q12029 327 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A TUS1Q06412 1307 aa0.98□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A CDC28P00546 298 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A CPA1P07258 411 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A RPL24BP24000 155 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A VMA6P32366 345 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A YBR209WP38311 105 aa0.98□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A YER076CP40049 302 aa0.98□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A YER085CP40058 173 aa0.98□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A BXI1P48558 297 aa0.98□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A GPM2Q12008 311 aa0.98□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A YDL180WQ12301 547 aa0.98□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A TDA8Q6B2U8 126 aa0.98□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A ATG40Q99325 256 aa0.98□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A VAR1P02381 398 aa0.97□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A RHO1P06780 209 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A DBF2P22204 572 aa0.97□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A SEC17P32602 292 aa0.97□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data0.97□□□□□ -2.25not detected
RPC10YHR143W-A GVP36P40531 326 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A POP3P53833 195 aaPredicted RBP0.97□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A UBC7Q02159 165 aa0.97□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A GAS3Q03655 524 aa0.97□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A MCP1Q12106 302 aa0.97□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A UBR2Q07963 1872 aa0.97□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A TIM9O74700 87 aa0.96□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A SIP3P38717 1229 aa0.96□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A NUP57P48837 541 aa0.96□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A ALG13P53178 202 aa0.96□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A SEY1Q99287 776 aa0.96□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A THP2O13539 261 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A RPL28P02406 149 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A YMR31P19955 123 aa0.95□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A UTP30P36144 274 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A MIC12P38341 106 aa0.95□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A YBR285WP38354 144 aa0.95□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A YRB1P41920 201 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A EAF6P47128 113 aa0.95□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A KNH1P50112 268 aa0.95□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A MSB2P32334 1306 aa0.94□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A SEC4P07560 215 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A URA5P13298 226 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A KSS1P14681 368 aa0.94□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A BET1P22804 142 aa0.94□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A PPA2P28239 310 aa0.94□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A AST2P39945 430 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A RMD6P39975 231 aa0.94□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A RIO2P40160 425 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A YDR249CQ03787 373 aa0.94□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A JLP1Q12358 412 aa0.94□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa0.94□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A YBR121C-AP0C5L4 52 aa0.93□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data0.93□□□□□ -2.26not detected
RPC10YHR143W-A MGM101P32787 269 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A BMH2P34730 273 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A OPY1P38271 328 aa0.93□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A RTC3P38804 111 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A OTU1P43558 301 aa0.93□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A MGA1P53050 456 aa0.93□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A YGR050CP53231 118 aa0.93□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A YKL183C-AQ3E765 70 aa0.93□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A YLR236CA0A023PZG4 107 aa0.92□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A SIR2P06700 562 aa0.92□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A GCN3P14741 305 aa0.92□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A PTM1P32857 523 aa0.92□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A PRX1P34227 261 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A RTR1P40084 226 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A ADO1P47143 340 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A NCB2Q92317 146 aa0.92□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A NHP6BP11633 99 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A SEC11P15367 167 aa0.91□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A RPB3P16370 318 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A MAG1P22134 296 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A YER034WP40022 185 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A ERG28P40030 148 aa0.91□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A IRC18P47056 224 aa0.91□□□□□ -2.26
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