RNA–Protein interactions for RNA: YGL154C

LYS5, Transcript of Phosphopantetheinyl transferase involved in lysine biosynthesis, yeast

Gene LYS5, Length 819 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LYS5	YGL154C	STD1	Q02794	444 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	YMR253C	Q04835	414 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	SRL2	Q12020	392 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	YLR118C	Q12354	227 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	SNF8	Q12483	233 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	PRB1	P09232	635 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	YUH1	P35127	236 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	BNA4	P38169	460 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	XBP1	P40489	647 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	AZF1	P41696	914 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	SNO3	P43544	222 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	YAP1802	P53309	568 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	APJ1	P53940	528 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	ATG39	Q06159	398 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	CNL1	Q06333	122 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	IZH3	Q07959	543 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	PAU23	Q07987	124 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	VAM3	Q12241	283 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	PAU17	Q12370	124 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	SLO1	Q3E784	85 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	FLO9	P39712	1322 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	SPS100	P13130	326 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	ANB1	P19211	157 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	MAK32	P23060	363 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	AFG1	P32317	509 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	HXT4	P32467	576 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	PPG1	P32838	368 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	YPC1	P38298	316 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	YHL044W	P38727	235 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	YHR122W	P38829	231 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	SPC25	P40014	221 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	STE24	P47154	453 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	IGO1	P53897	168 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	RHO4	Q00246	291 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	YML018C	Q03730	393 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	YDR248C	Q03786	193 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	RNH202	Q05635	350 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	IPK1	Q06667	281 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	ATG41	Q12048	136 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
LYS5	YGL154C	YPR011C	Q12251	326 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	FRE6	Q12473	712 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LYS5	YGL154C	COX2	P00410	251 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	MSW1	P04803	379 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	BOS1	P25385	244 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	RER1	P25560	188 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	POP5	P28005	173 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	PRE4	P30657	266 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	LOT5	P34234	306 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	PRY2	P36110	329 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	MRPS9	P38120	278 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	CHL4	P38907	458 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	MET28	P40573	187 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	UBC11	P52492	156 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	BOL2	P53082	120 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	RIM13	Q03792	727 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	GMC1	Q04399	608 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	NAT4	Q04751	285 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	ASM4	Q05166	528 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	KEI1	Q06346	221 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	CTR3	Q06686	241 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	MCH1	Q07376	486 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	COQ10	Q08058	207 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	UBX3	Q12229	455 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LYS5	YGL154C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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