RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	MPM1	P40364	252 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	AYR1	P40471	297 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	OTU1	P43558	301 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	PAU5	P43575	122 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YFL012W	P43580	148 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	IGO1	P53897	168 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	APS2	Q00381	147 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YMR160W	Q03823	816 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	BNA5	Q05979	453 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	NAT5	Q08689	176 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	ATG41	Q12048	136 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	JLP1	Q12358	412 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	ERP3	Q12403	225 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	COX19	Q3E731	98 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	FKS3	Q04952	1785 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	HEM2	P05373	342 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	ELO2	P25358	347 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YSC83	P32792	385 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	DOG2	P38773	246 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YJR015W	P47090	510 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	NIF3	P53081	288 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YGR066C	P53242	292 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	RTT102	P53330	157 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YPL077C	Q02831	240 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YMR166C	Q03829	368 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	AIM33	Q04516	312 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YPR114W	Q06107	315 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	KEI1	Q06346	221 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	CDD1	Q06549	142 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	SWC7	Q06707	132 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YOR385W	Q08909	290 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	SLM3	Q12093	417 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	NBP2	Q12163	236 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	GEP5	Q12393	293 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	IZH4	Q99393	312 aa		3	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	COX3	P00420	269 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	RIP1	P08067	215 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YCL068C	P25593	260 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	GAC1	P28006	793 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	PHD1	P36093	366 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	MIX23	P38162	196 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	DER1	P38307	211 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	DOG1	P38774	246 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	FLO5	P38894	1075 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	SRP14	P38985	146 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YER121W	P40076	114 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	PHS1	P40857	217 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YHC3	P47040	408 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YGR149W	P48236	432 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	BNS1	P50084	137 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YGL262W	P53054	175 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YGL235W	P53071	178 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	VHT1	P53241	593 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	MRPL19	P53875	158 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	RNH201	P53942	307 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	SUR7	P54003	302 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	TMA23	Q03525	211 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	THI74	Q04083	370 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	SCW10	Q04951	389 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	INM2	Q05533	292 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YLR456W	Q06199	204 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	CSI2	Q08054	341 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	NRT1	Q08485	598 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	SWT1	Q12104	458 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	PER33	Q12144	273 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	ORT1	Q12375	292 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YPL247C	Q12523	523 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.98	□□□□□ -1.93	not detected
ECO1	YFR027W	PPA2	P28239	310 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	PAU16	P35994	123 aa		2.98	□□□□□ -1.93

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