RNA–Protein interactions for RNA: YBR217W

ATG12, Transcript of Ubiquitin-like modifier involved in autophagy and the Cvt pathway, yeast

Gene ATG12, Length 561 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	YBR217W	SWT1	Q12104	458 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	FCY1	Q12178	158 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	TFC7	Q12415	435 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	PET54	P10834	293 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	SEC66	P33754	206 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	AIM25	P47140	327 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	DIE2	P50076	525 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	NRG1	Q03125	231 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	SRL1	Q08673	210 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	UBA3	Q99344	299 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	HYM1	P32464	399 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	YUH1	P35127	236 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	YNL234W	P53857	426 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	MIX17	Q03667	156 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	HOF1	Q05080	669 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	ATO3	Q12359	275 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	PET20	Q99373	253 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	GAL1	P04385	528 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	CAP2	P13517	287 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	PCL7	P40186	285 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	PRM5	P40476	318 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	BMT5	P40493	336 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	BNA1	P47096	177 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	YJR056C	P47115	236 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	MSE1	P48525	536 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	TPN1	P53099	579 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	YGR151C	P53287	111 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	MRPL22	P53881	309 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	GIM3	P53900	129 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	ASM4	Q05166	528 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	SYM1	Q06563	197 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	MED4	Q12343	284 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	DGK1	Q12382	290 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	CDC23	P16522	626 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	LSB5	P25369	354 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	PMU1	P36069	295 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	IKI1	P38874	309 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	POP2	P39008	433 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	LPP1	Q04396	274 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	PHO92	Q06390	306 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	YFH1	Q07540	174 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	YOR385W	Q08909	290 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	RDI1	Q12434	202 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG12	YBR217W	ADE8	P04161	214 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	PHO85	P17157	305 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	CPR4	P25334	318 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	ERG2	P32352	222 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	DAL3	P32459	195 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	YCR041W	P37265	110 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	POP8	P38208	133 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	COS8	P38723	381 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	YJL118W	P47022	219 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	STD1	Q02794	444 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	YPD1	Q07688	167 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	SCP1	Q08873	200 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	SPS2	P08459	502 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	ROX3	P25046	220 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	YCR061W	P25639	631 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	COQ2	P32378	372 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	MRP20	P32387	263 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	FLO10	P36170	1169 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	PSD1	P39006	500 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	YKE4	P40544	346 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	YIP1	P53039	248 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	MEH1	Q02205	184 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	THI74	Q04083	370 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	DAL4	Q04895	635 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	RTT103	Q05543	409 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	PEX10	Q05568	337 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG12	YBR217W	ENV7	Q12003	364 aa		4.7	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 104 ms